OMIM Entry – * 609631-DExD / H-BOX HELICASE 58; DDX58

TEXT

DDX58 on RNA-helikaasi, joka kuuluu kuolleiden/H-laatikoiden perheeseen. DEAD / H box-perheen jäsenillä on erilaisia rooleja geeniekspression ja solujen prosessien säätelyssä (Imaizumi et al., 2002).

käyttäen subtraktiivista hybridisaatiota lipopolysakkaridi (LPS)-indusoituvien geenien tunnistamiseksi endoteelisoluissa, minkä jälkeen seuraa rotu, Imaizumi et al. (2002) eristi cDNA koodaus DDX58, jota he kutsuivat Rigi. Imaizumi ym. (2002) totesi, että RIGI oli tunnistettu vuonna 1997 retinoiinihapon indusoituvaksi geeniksi promyelosyyttisessä leukemiasolulinjassa (GenBank AF038963). Ennustetun 925-aminohappoproteiinin laskennallinen molekyylimassa on 101 kD ja se kuuluu DEAD/H box-perheeseen. RIGI sisältää gxgkt-motiivin, mikä viittaa siihen, että kyseessä on RNA-helikaasi. Endoteelisoluista tehdyssä Northern blot-analyysissä havaittiin 3,0 kb: n transkriptio vasta LPS-stimulaation jälkeen.

Yoneyama et al. (2004) totesi, että RIGI on 2 kopiota caspase rekrytointi domain (CARD) sen n terminus lisäksi sen C-terminaali helicase domain.

Gross (2012) kartoitti DDX58-geenin kromosomiin 9p21.1 perustuen DDX58-sekvenssin (GenBank AF038963) sovittamiseen genomiseen sekvenssiin (GRCh37).

käyttäen subtraktiivista hybridisaatiota, Imaizumi et al. (2002) osoitti, että LPS: n stimuloimat endoteelisolut ilmentävät RIGI: tä ja COX2: ta (PTSG2; 600262). Northern blot, Western blot ja RT-PCR-analyysit osoittivat, että Rigi mRNA ja proteiini ilmentyivät endoteelisoluissa vasta LPS-stimulaation jälkeen pitoisuudesta riippuvalla tavalla. Rigi: n yliekspressio cox2 mRNA: n ja proteiinin selektiivinen ilmentyminen transfektoiduissa virtsarakon syöpäsoluissa ja indusoitu COX2-promoottorin aktiivisuus endoteelisoluissa.

RT-PCR ja Western blot analysis, Imaizumi et al. (2004) osoitti, että gamma-interferoni (IFNG; 147570)-stimuloidut napavaltimon sileälihassolut (SMCs) ilmentävät Rigi mRNA: ta ja proteiinia. Imaizumin ym. tekemät immunohistokemialliset ja konfokaalimikroskopiaanalyysit. (2004) osoitti Rigi: n sytoplasmisen ilmentymisen SMCs: ssä in vivo. Lisäksi immunoblotti ja mikroskooppiset analyysit osoittivat, että IFNG stimuloi RIGI: n ilmentymistä napalaskimossa. RIGI-ilmentymistä havaittiin myös normaaleissa ihmisen keuhkojen endoteelisoluissa.

Cui et al. (2004) havaittu RIGI ilmentymä IFNG-stimuloitu rintasyövän solulinjassa. Rigi: n yliekspressio ISG15: n yliekspressio (G1P2; 147571).

Yoneyama et al. (2004) osoitti, että kaksijuosteinen RNA (dsRNA) indusoi Rigi: n ilmentymistä ATPaasi-riippuvaisella tavalla ja lisäsi tyypin I interferonin tuotantoa (esim.IFNB; 147640). Lyhennetty muoto RIGI puuttuu helicase domain mutta sisältää tandem kortin motiivit transduced signaalit johtavat aktivointi IRF3 (603734) ja NFKB (katso 164011). Käyttämällä RNA-häiriöitä, Yoneyama et al. (2004) totesi, että RIGI oli välttämätön viruksen aiheuttaman ilmentymisen IRF3. He totesivat, että RIGI on välttämätön viruksen monistuvien genomien havaitsemiseksi ja hävittämiseksi.

käyttäen hepatiitti C-virusta (HCV; 609532) replikon-expressing cell line, Breiman et al. (2005) osoitti, että HCV NS3/4A-proteaasi heikensi IFNB: n tuotantoa sekä TRIF: stä (TICAM1; 607601) riippuvaisilla että TRIF: stä riippumattomilla reiteillä. Ne osoittivat, että trif-riippumattoman reitin heikkeneminen johtui NS3/4A. Breiman ym.: n RIGI-välitteisen IFNB-promoottorin aktivoinnin estämisestä. (2005) ehdotti, että RIGI on keskeinen tekijä TRIF-riippumaton, NS3/4A-herkkä polku IFNB aktivointi.

Li ym. (2005) todettiin, että hepatooma solut eivät näytä tietullin kaltainen reseptori-3 (TLR3; 603029)-riippuvainen IFNB aktivointi vastauksena dsRNA analoginen, poly(I-C), kun taas nonneoplastinen hepatosyyttien osoitti vankka TLR3-riippuvainen IFNB ilmentymä vastauksena poly(I-C). Toisin kuin poly (I-C), sekä hepatooma että normaalit hepatosyyttien solulinjat tuottivat IFNB: tä vastauksena Sendai-virukselle tlr3-riippumattomalla, RIGI-riippuvaisella tavalla. RIGI-ilmentymän vaimentaminen heikensi Sendai-viruksen vastetta, mutta ei poly(I-C) – virusta. Li ym. (2005) totesi, että maksasolut sisältävät 2 erillistä antiviraalista signalointireittiä, jotka johtavat tyypin I interferonin ilmentymiseen, joista toinen on riippuvainen TLR3: sta ja toinen Rigi: stä.

Hornung ym. (2006) osoitti, että viruksen polymeraasien tuottaman RNA: n 5-alkutrifosfaattipää vastaa RNA-molekyylien RIGI-välitteisestä havaitsemisesta. 5-prime-trifosfaatti-RNA: n osoittaminen kumotaan sulkemalla 5-prime-trifosfaattipäätä tai RNA: n nukleosidimuunnoksella, jotka molemmat tapahtuvat eukaryooteilla transcriptionaalisen RNA: n käsittelyn aikana. Negatiivisjuosteisesta RNA-viruksesta valmistettu genominen RNA ja viruksen infektoimista soluista (mutta ei infektoimattomista soluista) valmistettu RNA laukaisivat voimakkaan alfainterferonivasteen (IFNA; 147660) fosfataasiherkällä tavalla. Viiden prime-trifosfaatti-RNA sitoutuu suoraan RIGIIN. Näin ollen rajaamaton 5-prime-trifosfaatti-RNA (3prna) esiintyy viruksissa, joiden tiedetään olevan RIGI: n tunnistamia, mutta puuttuu viruksissa, joiden tiedetään olevan MDA5: n (606951) havaitsemia, kuten picornaviruksissa, toimii molekulaarisena merkkinä Rigi: n virusinfektioiden toteamisessa.

Pichlmair ym. (2006) osoitti, että influenssa A-virusinfektio ei tuota dsRNA: ta ja että RIGI aktivoituu viruksen genomisesta yksijuosteisesta RNA: sta (ssRNA), jossa on 5-prime-fosfaatteja. Tätä estää influenssaproteiini nonstructured protein 1 (NS1), jota on Rigi-kompleksissa infektoiduissa soluissa. Pichlmair ym. (2006) totesi, että nämä tulokset tunnistivat Rigin ssRNA-sensoriksi ja viruksen immuunivuodon potentiaaliseksi kohteeksi, ja ehdotti, että sen kyky aistia 5-prime-fosforyloitua RNA: ta kehittyi synnynnäisessä immuunijärjestelmässä keinona erottaa itsensä ja ei-itsensä.

Gack ym. (2007) raportoi, että RIGI: n n-terminaaliset caspase-rekrytointidomeenit (CARDs) käyvät läpi vahvan ubikitinaation, jonka trim25 (600453) indusoi nisäkässoluissa. TRIM25: n C-terminaalinen SPRY-verkkotunnus on vuorovaikutuksessa RIGI: n n-päätekorttien kanssa; tämä vuorovaikutus tuottaa tehokkaasti lys63-linkitetyn ubikitiiniosan RIGI: n n-päätekortteihin, mikä johtaa RIGI: n loppupään signalointitoiminnan huomattavaan kasvuun. RIGI: n lys172-jäännös on kriittinen tehokkaan trim25-välitteisen ubikitinaation ja Mavs: n (609676) sitoutumisen kannalta sekä RIGI: n kyvylle indusoida antiviraalista signaalinsiirtoa. Geenien kohdistaminen osoitti, että TRIM25 on välttämätön Rigi: n ubikitinaation lisäksi myös RIGI-välitteisen interferonibeetan tuotannolle ja antiviraaliselle vaikutukselle vasteena RNA-virusinfektiolle. Näin ollen Gack et al. (2007) osoitti, että trim25 E3 ubikitiiniligaasi indusoi RIGI: n lys63-linkitettyä ubikitinaatiota, mikä on ratkaisevan tärkeää sytosolisen RIGI-signalointireitille isäntäeläimen antiviraalisen synnynnäisen immuniteetin aikaansaamiseksi.

käyttäen hiiva 2-hybridianalyysiä, Arimoto et al. (2007) eristetty rnf125 (610432) ubikitiinin kaltaisena proteiinina, jolla on E3-ligaasiaktiivisuus ja joka reagoi E2-entsyymin UBCH8 (UBE2L6; 603890) kanssa. Lisäksi he havaitsivat, että RIGI oli vuorovaikutuksessa UBCH8: n ja RNF125: n kanssa. Rigi: n vuorovaikutus RNF125: n kanssa edellytti Rigi: n korttialuetta ja C-terminaalialuetta. Rnf125: n alasäätely pienen häiritsevän RNA: n avulla vähensi RIGI: n tasoja ja esti RIGI: n polyubikvitinaation. Rnf125: n cys72: n ja cys75: n mutaatio ala: lle poisti sen kyvyn välittää Rigi ubikitinaatiota. IFNA upregulated expression of rnf125, UBCH5 (UBE2D1; 602961), ja RIGI. Arimoto ym. (2007) totesi, että rnf125 ubikitinaatiofunktio toimii IFN: n tuotannon negatiivisena sääntelyreittinä.

Saito ym. (2007) havaitsi, että RIGI ja LGP2 (608588), mutta ei MDA5, sitoivat tehokkaasti HCV-RNA: ta antamaan IFNB-ilmaisun. HCV-infektion ja RNA: n sitoutumisen jälkeen RIGI siirtyi monomeerista itseään yhdistävään proteiiniin, joka myös interaktioi KORTTIALUEENSA kautta IPS1: n (HISPPD2A; 610979) kanssa signaloidakseen IRF3 – ja NFKB-reagoivia geenejä. Mutaatioanalyysi osoitti, että Rigi-multimerisaatioon ja IPS1-interaktioon tarvittiin RIGI C-terminal repressor domain (Rd). Tutkimus-ja kehitystyön poistaminen johti PERUSSIGNALOINTIIN IFNB: n järjestäjälle, kun taas pelkkä tutkimus-ja kehitystyön ilmaisu esti signaloinnin ja lisäsi solujen sallivuutta HCV: lle. Saito ym. (2007) tunnistettu analoginen RD LGP2 että vuorovaikutuksessa trans RIGI ablate itse-yhdistys ja signalointi. He päättelivät, että RIGI on HCV: n patogeenintunnistusreseptori ja että sen RD on keskeinen HCV-infektiota ja sen tuotantoa säätelevän isäntäpuolustuksen modulaattori. Saito ym. (2007) ehdotti, että Rigi/LGP2-interaktiodynamiikan modulaatiolla voi olla terapeuttisia vaikutuksia immuunisäätelyyn.

RT-PCR, Western blot, and fluoresence microscopy analyses, Zhang et al. (2008) havaittu lisääntynyt ilmentyminen RIGI ihmisen ja hiiren myelooinen leukemiasoluja retinoiinihapon indusoima terminaalinen granulosyyttinen erilaistuminen, mikä viittaa siihen, että RIGI expression on developmently säännelty yhdessä myelooinen erilaistumista. Hiirille, joilta Rigi puuttui, kehittyi etenevä granulosytoosi ja krooninen myelooinen leukemia (KS.KML; 608232). Progressiiviseen granulopoieesiin liittyi Icsbp1: n (601565) pelkistynyt ilmentyminen. Zhang ym. (2008) totesi, että RIGI: llä on kriittinen sääntelytehtävä granulosyyttien muodostumisen ja erilaistumisen moduloinnissa.

RIGI on sytosolinen monidomiiniproteiini, joka havaitsee viruksen RNA: ta ja saa aikaan antiviraalisen immuunivasteen. Kaksi n-päätekortin verkkotunnusta lähettää signaalia, ja säätelyalue estää signaloinnin viruksen RNA: n puuttuessa. Five-prime-trifosfaatti ja dsRNA ovat 2 molekyylikuviota, joiden avulla RIGI pystyy erottelemaan patogeenin itse-RNA: sta. Käyttämällä yhden molekyylin proteiinin indusoimaa fluoresenssia, Myong et al. (2009) löysi Rigi: n vahvan adenosiini-5-prime trifosfaattikäyttöisen dsRNA-translokaatioaktiivisuuden. Kortit estävät translokaation dramaattisesti 5-prime-trifosfaatin puuttuessa, ja 5-prime-trifosfaatin aktivoituminen laukaisee Rigin translokaation ensisijaisesti dsRNA: lla cis: ssä. Myong ym. (2009) totesi, että tämä funktionaalinen 2 RNA: n molekyylikuvioiden integrointi voi tarjota keinon tunnistaa ja torjua lisääntyviä viruksia.

Oshiumi et al. (2010) totesi, että RIPLET (RNF135; 611358) välittää RIGI C-terminaalin repressorialueen ja N-päätekorttien lys63-linkitettyä polyubikvitaatiota. He havaitsivat, että riplet -/- hiirten fibroblastit, makrofagit ja dendriittisolut olivat viallisia tuottamaan IFN: ää ja muita sytokiineja vastauksena RNA-virusten aiheuttamaan infektioon, mutta eivät DNA-virusten. Ripletin puute poisti Rigi-aktivaation RNA-virustartunnan aikana, ja Riplet -/- hiiret olivat alttiimpia vesicular stomatitis-virustartunnalle. Oshiumi ym. (2010) totesi, että RIPLET on välttämätön RIGI-välitteisen synnynnäisen immuunivasteen säätelemiseksi RNA-virusinfektiota vastaan In vivo.

Kok ym. (2011) totesi, että RIGI jakaa rakenteellisen samankaltaisuuden DICERIN (606241) kanssa, joka on RNA-interferenssiä välittävä RNaasi III-tyyppinen nukleaasi ja vaatii dsRNA: ta sitovia kumppaneita, kuten PACT (PRKRA; 603424), optimaaliseen aktiivisuuteen. He osoittivat, että sopimus oli fyysisesti sidottu Rigi: n C-terminaaliseen sortoalueeseen ja kannustivat RIGI: n aiheuttamaa I-tyypin IFN-tuotantoa. PACT voimisti poly(I:C): n aiheuttamaa RIGI-aktivaatiota ja auttoi ylläpitämään antiviraalisia vasteita. Kok ym. (2011) totesi, että PACT: llä on tärkeä rooli RIGI-riippuvaisten antiviraalisten vasteiden käynnistämisessä ja ylläpitämisessä.

Goubau ym. (2014) osoitti, että Rigi, koodattu DDX58, välittää antiviraalisia vasteita RNAS joissa 5-prime-difosfaatit (5-prime-pp) sekä ne, joissa 5-prime-trifosfaatit (5-prime-ppp). Nisäkkäiden reovirusten genomit, joissa on 5-prime-pp-termini, 5-prime-pp-RNA eristettynä hiivan L-A-viruksesta, ja emäspariset 5-prime-pp Rnat, jotka on valmistettu in vitro-transkriptiolla tai kemiallisella synteesillä, sitoutuvat kaikki RIGIIN ja toimivat RIGI-agonisteina. Lisäksi RIGI-riippuvainen vaste 5-prime-pp-RNA: lle on välttämätön reovirusinfektion hallitsemiseksi viljellyissä soluissa ja hiirissä. Goubau ym. (2014) päätteli, että Rigi-tunnistuksen minimaalinen determinantti on emäsparinen RNA, jossa on 5-prime-pp. Tällaisia RNA: ita on eräissä viruksissa, mutta ei infektoimattomissa soluissa, mikä osoittaa, että 5-prime-pp-RNA: n, kuten 5-prime-ppp-RNA: n, tunnustaminen toimii voimakkaana keinona erottaa luontainen immuunijärjestelmä itsestään.

tdp43: n (TARDBP; 605078) mutaatiot, mukaan lukien ala315-to-thr (A315T; 605078.0009), ovat harvinainen amyotrofisen lateraaliskleroosin (ALS10; 612069) aiheuttaja. Tdp43: n patologia, joka koodaa RNA: n käsittelyyn osallistuvaa RNA: ta sitovaa ribonukleaarista proteiinia, on kuitenkin yleinen yli 95 prosentissa ALS-tapauksista. Siirtogeeniset Tdp43 A315T-hiiret kehittävät iästä riippuvan motoneuronirappeuman ja toimivat ALS: n mallina. Käyttämällä kääntäminen ribosomien affiniteetti puhdistus ja microarray analyysi, MacNair et al. (2016) havaitsi, että useita mrnoja säädeltiin epänormaalisti 10 kuukauden ikäisillä oireisilla tdp43 A315T-hiirillä verrattuna villityyppisiin kontrolleihin ja 5 kuukauden ikäisillä presymptomaattisilla Tdp32 A315T-hiirillä. Virheellisen mRNAs: n joukossa oli Ddx58, joka oli mutanttihiirillä yli 2-kertainen. Immunohistokemiallinen analyysi osoitti epänormaalin kohonnutta Ddx58-ilmentymää motoneuronien sytoplasmassa 10 kuukauden ikäisillä tdp43 A315T-hiirillä. Ihmisen DDX58: n ilmentymistä säädeltiin myös motorisissa neuroneissa ja niitä ympäröivissä gliasoluissa sporadisten ja familiaalisten ALS-potilaiden selkäytimissä. RNA-immunopresipitaatioanalyysi osoitti, että Ddx58 oli tdp43: n suora kohde transfektoiduissa hiiren neuroblastoomasoluissa.

kiderakenne

helikaasin ja repressoridomeenin välisen synergian ymmärtämiseksi RNA: n sitoutumisessa sekä ATP: n hydrolyysin osuuden RIGI-aktivaatiossa, Jiang et al. (2011) määritti ihmisen Rigi helicase repressor domeenin rakenteen kompleksissa dsRNA: n ja ATP-analogin kanssa. Helicase repressor domain järjestäytyy rengas ympäri dsRNA, yläraja toinen pää, samalla yhteyttä molempiin säikeisiin käyttäen aiemmin epätyypillisiä motiiveja tunnistaa dsRNA. Pienikulmainen röntgensironta, rajoitettu proteolyysi ja differentiaaliskannaus fluorimetria osoittivat, että RIGI on laajennetussa ja joustavassa konformaatiossa, joka tiivistyy RNA: n sitoutuessa. Nämä tulokset antoivat yksityiskohtaisen kuvan helikaasin roolista dsRNA: n tunnistamisessa, repressoridomeenin ja helikaasin välisestä synergiasta RNA: han sitoutumisessa sekä dsrna: han sitoutuneen täyspitkän RIGI: n järjestämisestä ja antoivat näyttöä konformaatiomuutoksesta RNA: han sitoutumisessa. RIGI helicase repressor domain-rakenne on dsRNA-translokaation mukainen ilman purkautuvaa ja yhteistoiminnallista sitoutumista RNA: han. Rakenne tuotti ennennäkemättömän käsityksen synnynnäisestä immuniteetista ja sillä oli laajempi vaikutus muihin biologian alueisiin, kuten RNA-interferenssiin ja DNA: n korjaukseen, jotka hyödyntävät homologisia helikaasudomeeneja DICERIN (606241) ja FANCM: n (609644) kanssa.

Peisley ym. (2014) raportoi kiderakenne tetrameeri ihmisen Rigi tandem caspase aktivointi ja rekrytointi domain (2card) sidottu 3 ketjut lys63-linkitetty diubikvitiini (K63-Ub2). 2CARD kokoaa kierteisen tetrameerin, joka muistuttaa ”lukkopesuria”, jossa tetrameerinen pinta toimii signalointialustana loppupään signalointimolekyylin, MAVS: n (609676), rekrytoinnissa ja aktivoinnissa. Ubikitiiniketjut sidotaan kierteisen liikeradan ulkoreunaa pitkin, jolloin 2cardin vierekkäiset alayksiköt yhdistyvät ja 2card-tetrameeri stabiloituu. Rakenne – ja funktionaalianalyysien yhdistelmä osoitti, että sitova aviditeetti sanelee 2CARDIN K63-sidoksen ja ketjun pituusspesifisyyden, ja että 2cardin kovalenttinen ubikitiinikonjugaatio stabiloi edelleen Ub-2card-vuorovaikutusta ja siten 2CARD-tetrameeria.

Singleton-Mertenin syndrooma 2

suuressa 4 sukupolven korealaisessa perheessä, jolla oli glaukooma, aortan ja läppävian kalkkeutuminen sekä luuston anomalioita (Sgmrt2; 616298), Jang et al. (2015) tunnistettu heterotsygoottisuus MISSENSE-mutaatiolle DDX58-geenissä (E373A; 609631.0001), joka erottautui taudin kanssa. Sairastuneet henkilöt toisessa korealaisessa sgmrt2-perheessä, joilla oli vain glaukooma ja luuston anomalioita, olivat heterotsygootteja eri MISSENSE-mutaatiolle ddx58: ssa (C268F; 609631.0002). Funktionaalianalyysi osoitti, että molemmat mutaatiot aiheuttavat konstitutiivista aktivaatiota ja lisäävät interferonin aktiivisuutta ja interferonin stimuloimaa geeniekspressiota.

liitokset odottavat vahvistusta

, koska tuhkarokkorokotuksen primaarinen epäonnistumisprosentti on 2-10% ja koska luontainen immuniteetti estää tai vähentää viruksen replikaatiota ja leviämistä, kunnes Adaptiivinen immuunivaste viruksen poistamiseksi, Haralambieva ym. (2011) teki kattavan kandidaattigeeniyhdistystutkimuksen rodullisesti monimuotoisessa 745 terveen koululaisen kohortissa Minnesotassa, jolla oli ollut 2 annosta tuhkarokkorokotetta. Ddx58: n variantteihin liittyi tuhkarokolle spesifisiä vasta-ainemuutoksia valkoihoisilla. Neljään DDX58 polymorfismiin suuressa yhteyshäiriössä liittyi myös tuhkarokkospesifisen IFNG: n ja il2: n (147680) erityksen vaihteluita valkoihoisilla. ADAR (146920)-muunnoksilla oli myös rooli tuhkarokon spesifisten IFNG-vasteiden säätelyssä valkoihoisilla. Kaksi intronista OAS1 (164350) SNP: tä liittyi kohonneeseen neutralisoivaan vasta-ainepitoisuuteen afroamerikkalaisilla. Haralambieva ym. (2011) totesi, että useat synnynnäiset immuniteettigeenit ja geenivariantit ovat todennäköisesti mukana muuntamassa adaptiivista immuunivastetta elävään heikennettyyn tuhkarokkorokotteeseen valkoihoisilla ja afroamerikkalaisilla.

Kato et al. (2005) tuotti Rigi-puutteellisia hiiriä ja, käyttäen soluja näistä hiiristä, todettiin, että Rigi, eikä TLR-järjestelmä, oli keskeinen rooli antiviraalisten vasteiden fibroblastien ja tavanomaisten dendriittisten solujen (DCS). Sen sijaan runsaasti IFNA: ta (147660) tuottavien plasmasytoidien DCS-vasteissa käytettiin Rigi: n sijaan TLR-järjestelmää, pääasiassa Tlr7: ää (300365) ja tlr9: ää (605474). Rigi – / – hiiret selvisivät harvoin syntymään asti, ja alkioiden day-12.5-hiirten histologisessa tutkimuksessa havaittiin massiivinen maksan rappeutuminen. Eloonjääneiden kasvu oli hidastunut ja he kuolivat 3 viikon kuluessa syntymästä.

hiirillä, joilla oli MDA5: n (606951), Kato et al. (2006) osoitti, että MDA5 ja RIG1 tunnistavat erilaisia kaksisäikeisiä RNAs: MDA5 tunnistaa polyinosiini-polysytidyylihapon ja RIG1 tunnistaa in vitro transkriboidun kaksijuosteisen RNAs: n. RNA-virukset tunnistaa toisistaan myös rig1 ja MDA5. Kato ym. (2006) todettiin, että RIG1 on välttämätön interferonien tuottamiseksi vastauksena RNA-viruksille, mukaan lukien paramyksovirukset, influenssavirus ja Japanin enkefaliittivirus, kun taas MDA5 on kriittinen pikornaviruksen toteamisessa. Lisäksi rig1-null-ja Mda5-null-hiiret ovat erittäin herkkiä tarttumaan näihin vastaaviin RNA-viruksiin verrattuna kontrollihiiriin. Kato ym. (2006) totesi, että yhdessä niiden tiedot osoittavat, että RIG1 ja MDA5 erottavat eri RNA-virukset toisistaan ja ovat kriittisiä isäntien antiviraalisten vasteiden kannalta.