we wrześniu 1957 roku, z Pomocą Daisy Bates, prominentnej działaczki Praw Obywatelskich w środkowym Arkansas, Malinda Brown postanowiła zintegrować Little Rock Central High School z ośmioma innymi afroamerykańskimi uczniami. Uczniowie początkowo próbowali wejść do szkoły 4 września 1957, ale zostali zatrzymani przez Gwardię Narodową Arkansas wezwaną przez gubernatora Orvala Faubusa. W odpowiedzi prezydent Dwight D. Eisenhower wysłał 1200 amerykańskich spadochroniarzy ze 101 Dywizji Powietrznodesantowej, aby pomóc Little Rock Nine w wejściu do szkoły. 25 września 1957 roku Brown-Trickey wraz z ośmioma innymi uczniami desegregował Little Rock Central High School.
pomimo stacjonowania wojsk w liceum przez cały rok szkolny’57-’ 58, dziewięciu uczniów było fizycznie i słownie nękanych przez kolegów z klasy. Brown-Trickey była pierwszą zawieszoną z Little Rock Nine i jako jedyna została wydalona. Jej zawieszenie było wynikiem incydentu, który miał miejsce 17 grudnia 1957. Podczas spaceru po zatłoczonej stołówce podczas lunchu, Brown-Trickey była nękana i skończyła upuszczając tacę na lunch i rozlewając chili na dwóch studentów. Została zawieszona w szkole na sześć dni. Po zawieszeniu Minnijean wróciła do szkoły, a biały uczeń rozlał na nią zupę. Został zawieszony tylko na dwa dni. Później, w lutym, grupa dziewcząt rzuciła torebkę wypełnioną zamkami szyfrowymi w Minnijean. Odpowiedziała nazywając dziewczyny „białymi śmieciami”i została natychmiast wydalona. Po jej wydaleniu uczniowie z Central przekazali notatkę, w której napisali: „jeden z głowy, zostało ośmiu.”
po incydencie Brown-Trickey przeniósł się do Nowego Jorku i mieszkał z dr Kennethem B. i Mamie Clark. Clarks byli Afroamerykańskimi psychologami, którzy pomogli w argumencie przedstawionym przez National Association for the Advancement of Colored People (NAACP) w sprawie Brown v. Board of Education.
Brown-Trickey uczęszczał do New Lincoln School na Manhattanie w 11 i 12 klasie.