rum har tre hovedroller. Den ene er at etablere fysiske grænser for biologiske processer, der gør det muligt for cellen at udføre forskellige metaboliske aktiviteter på samme tid. Dette kan omfatte at holde visse biomolekyler inden for en region eller holde andre molekyler udenfor. Inden for de membranbundne rum isoleres forskellige intracellulære pH-værdier, forskellige systemer og andre forskelle fra andre organeller og cytosol. Med mitokondrier har cytosolen et iltningsmiljø, der omdanner NADH til NAD+. I disse tilfælde er opdelingen fysisk.
en anden er at generere et specifikt mikromiljø til rumligt eller midlertidigt at regulere en biologisk proces. Som et eksempel syrnes en gærvakuol normalt af protontransportører på membranen.
en tredje rolle er at etablere specifikke placeringer eller cellulære adresser, for hvilke processer skal forekomme. For eksempel kan en transkriptionsfaktor rettes mod en kerne, hvor den kan fremme transkription af visse gener. Med hensyn til proteinsyntese er de nødvendige organeller relativt tæt på hinanden. Nucleolus i den nukleare kuvert er placeringen af ribosomsyntese. Destinationen for syntetiserede ribosomer til proteinoversættelse er groft endoplasmatisk retikulum (ru ER), som er forbundet med og deler den samme membran med kernen. Golgi-kroppen er også tæt på den hårde ER til emballering og omfordeling. Ligeledes tillader intracellulær rumdeling specifikke steder med relaterede eukaryote cellefunktioner isoleret fra andre processer og derfor effektive.