i September 1957 med hjælp fra Daisy Bates, en fremtrædende borgerrettighedsaktivist i det centrale Arkansas, Malinda brun satte sig for at integrere Little Rock Central High School sammen med otte andre afroamerikanske studerende. Eleverne forsøgte oprindeligt at komme ind på skolen den 4.September 1957, men blev stoppet af Arkansas National Guard indkaldt af guvernør Orval Faubus. 1.200 amerikanske faldskærmstropper fra 101. luftbårne Division for at hjælpe Little Rock Nine med at komme ind i skolen. Den 25.September 1957 desegregerede brun-Trickey sammen med de andre otte studerende Little Rock Central High School.
på trods af at tropperne blev stationeret på gymnasiet gennem skoleåret ’57-’58, blev de ni studerende fysisk og verbalt chikaneret af deres klassekammerater. Brun-Trickey var den første suspenderet ud af Little Rock Nine, og hun var den eneste, der blev udvist. Hendes suspension var resultatet af en hændelse, der fandt sted den 17.December 1957. Mens du går gennem den overfyldte cafeteria under frokosten, brun-Trickey blev chikaneret og endte med at droppe sin frokostbakke og spilde chili på to mandlige studerende. Hun blev suspenderet fra skolen i seks dage. Efter hendes suspension kom Minnijean tilbage til skolen, og en hvid studerende spildte suppe på hende. Han blev kun suspenderet i to dage. Senere, i Februar, en gruppe piger kastede en pung fyldt med kombinationslåse mod Minnijean. Hun svarede ved at kalde pigerne “hvidt affald” og blev straks udvist. Efter hendes udvisning, studerende på Central bestået en note omkring som erklærede, ” en ned, otte til at gå.”
efter hændelsen flyttede brun-Trickey til Ny York og boede hos Drs. Kenneth B. og Mamie Clark. Clarks var afroamerikanske psykologer, der hjalp med argumentet fra National Association for the Advancement of Colored People (NAACP) i den brune v. Board of Education-sag.
brun-Trickey deltog i den nye Lincoln School i Manhattan for 11.og 12. klasse.