Im September 1957 machte sich Malinda Brown mit Hilfe von Daisy Bates, einer prominenten Bürgerrechtlerin im Zentrum von Arkansas, daran, die Little Rock Central High School neben acht anderen afroamerikanischen Schülern zu integrieren. Die Schüler versuchten ursprünglich, die Schule am 4. September 1957 zu betreten, wurden aber von der Arkansas National Guard gestoppt, die von Gouverneur Orval Faubus einberufen wurde. Daraufhin schickte Präsident Dwight D. Eisenhower 1.200 US-Fallschirmjäger der 101st Airborne Division, um die Little Rock Nine beim Betreten der Schule zu unterstützen. Am 25. September 1957 Brown-Trickey zusammen mit den anderen acht Studenten desegregated Little Rock Central High School.
Obwohl die Truppen während des gesamten Schuljahres ’57-’58 an der High School stationiert waren, wurden die neun Schüler von ihren Klassenkameraden körperlich und verbal belästigt. Brown-Trickey war die erste, die aus den Little Rock Nine suspendiert wurde, und sie war die einzige, die ausgewiesen wurde. Ihre Suspendierung war das Ergebnis eines Zwischenfalls, der sich am 17.Dezember 1957 ereignete. Während sie während des Mittagessens durch die überfüllte Cafeteria ging, Brown-Trickey wurde belästigt und ließ ihr Mittagstablett fallen und verschüttete Chili auf zwei männliche Studenten. Sie wurde für sechs Tage von der Schule suspendiert. Nach ihrer Suspendierung, Minnijean kam zurück in die Schule und ein weißer Schüler verschüttete Suppe auf sie. Er wurde nur für zwei Tage suspendiert. Später, im Februar, warf eine Gruppe von Mädchen eine mit Zahlenschlössern gefüllte Handtasche nach Minnijean. Sie antwortete, indem sie die Mädchen „White Trash“ nannte und sofort ausgewiesen wurde. Nach ihrer Vertreibung, Studenten im Central gaben eine Notiz weiter, in der stand, „Eins runter, acht zu gehen.“
Nach dem Vorfall zog Brown-Trickey nach New York und lebte bei Drs. Kenneth B. und Mamie Clark. Die Clarks waren afroamerikanische Psychologen, die mit dem Argument der National Association for the Advancement of Colored People (NAACP) im Fall Brown v. Board of Education halfen.
Brown-Trickey besuchte die New Lincoln School in Manhattan für die 11. und 12.