La conversion au christianisme de l’Albanie a eu lieu sous l’influence « latine » (rite romain) au nord, sous l’influence « grecque » (rite byzantin) au sud, et le christianisme était la première et la plus ancienne religion monothéiste du peuple albanais. Après la conquête ottomane du XVe siècle, environ les deux tiers de la population ont accepté l’islam. En 1967, l’Albanie sous domination communiste a été officiellement déclarée État athée.
Bien que le rite liturgique grec soit utilisé dans nombre de ses églises, l’Albanie fait partie du patriarcat de Rome jusqu’en 731, lorsque l’empereur byzantin Léon III, en représailles de l’opposition du pape Grégoire III à la politique iconoclaste de l’empereur, rattache l’ensemble de l’Illyrie orientale au patriarcat de Constantinople.
Les catholiques de rite romain étaient établis de longue date dans le nord du pays. Une mission catholique a travaillé dans le sud entre 1660, lorsque l’archevêque orthodoxe a rejoint l’Église catholique, et 1765, lorsque l’effort a été abandonné à cause des obstacles placés par les dirigeants ottomans. En 1895, un groupe de villages de Mali Shpati, au sud-est d’Elbasan dans le centre de l’Albanie, a décidé de devenir catholique et a exigé un évêque de leur propre rite, une proposition à laquelle les représentants consulaires de la Russie et du Monténégro ont soulevé des objections auprès des autorités civiles. À peu près au même moment, un autre groupe de gréco-catholiques est apparu, centré sur un archimandrite, George Germanos, neveu du métropolite orthodoxe en 1900, et a conclu un mouvement définitif d’unité catholique formé à Elbasan. Le nombre n’a augmenté que dans une faible mesure, mais suffisamment pour que le sud de l’Albanie devienne en 1939 une juridiction ecclésiastique distincte sous la responsabilité d’un administrateur apostolique. Cependant, après moins de sept ans, l’administrateur a été expulsé et le contact semblait perdu avec les fidèles byzantins, qui se sont retrouvés sous un régime communiste strict.
Ce n’est qu’en 1992 qu’il a été possible de nommer un nouvel administrateur apostolique. Au début, le poste a été confié au représentant diplomatique du Saint-Siège à Tirana, Mgr Ivan Dias, qui est devenu plus tard archevêque de Mumbai et cardinal. Le successeur de Mgr Dias en tant qu’Administrateur apostolique du Sud de l’Albanie, et non comme Nonce, est l’évêque franciscain de rite byzantin d’origine croate Hil Kabashi, nommé en 1996.
L’administration apostolique du Sud de l’Albanie compte 3 200 catholiques dans neuf paroisses, avec 11 églises, et est desservie par quatre prêtres diocésains et 10 religieux, 10 religieux de sexe masculin et 97 religieux de sexe féminin, qui administrent 10 écoles et 20 institutions caritatives. La grande majorité d’entre eux sont de Rite romain.