Die Bekehrung Albaniens zum Christentum fand unter „lateinischem“ (römischem Ritus) Einfluss im Norden, unter „griechischem“ (byzantinischem Ritus) im Süden statt, und das Christentum war die erste und älteste monotheistische Religion des albanischen Volkes. Jahrhundert akzeptierten etwa zwei Drittel der Bevölkerung den Islam. 1967 wurde das kommunistisch regierte Albanien offiziell zum atheistischen Staat erklärt.
Obwohl der griechische liturgische Ritus in vielen seiner Kirchen verwendet wurde, war Albanien bis 731 Teil des Patriarchats von Rom, als der byzantinische Kaiser Leo III. als Vergeltung für die Opposition von Papst Gregor III.
Katholiken des römischen Ritus waren im Norden des Landes seit langem etabliert. Eine katholische Mission arbeitete im Süden zwischen 1660, als der orthodoxe Erzbischof der katholischen Kirche beitrat, und 1765, als die Bemühungen aufgrund von Hindernissen der osmanischen Herrscher aufgegeben wurden. 1895 beschloss eine Gruppe von Dörfern in Mali Shpati, südöstlich von Elbasan in Zentralalbanien, katholisch zu werden und forderte einen Bischof ihres eigenen Ritus, ein Vorschlag, gegen den die konsularischen Vertreter Russlands und Montenegros Einwände bei den Zivilbehörden erhoben. Etwa zur gleichen Zeit entstand eine weitere Gruppe griechisch-katholischer Katholiken, die sich auf einen Archimandriten, George Germanos, konzentrierte, der 1900 ein Neffe des orthodoxen Metropoliten war, und eine endgültige Bewegung der katholischen Einheit in Elbasan abschloss. Die Zahlen wuchsen nur in geringem Maße, aber genug für Südalbanien, um 1939 eine separate kirchliche Gerichtsbarkeit in der Obhut eines Apostolischen Administrators zu werden. Nach weniger als sieben Jahren wurde der Administrator jedoch ausgewiesen, und der Kontakt zu den byzantinischen Gläubigen schien verloren, die sich unter strenger kommunistischer Herrschaft befanden.
Erst 1992 konnte ein Neuapostolischer Administrator ernannt werden. Zunächst wurde der Posten dem diplomatischen Vertreter des Heiligen Stuhls in Tirana, Erzbischof Ivan Dias, übertragen, der später Erzbischof von Mumbai und Kardinal wurde. Erzbischof Dias Nachfolger als Apostolischer Administrator von Südalbanien, nicht als Nuntius, ist der in Kroatien geborene Franziskanerbischof byzantinischen Ritus Hil Kabashi, der 1996 ernannt wurde.
Die apostolische Verwaltung Südalbaniens hat 3.200 Katholiken in neun Pfarreien mit 11 Kirchen und wird von vier Diözesanpriestern und 10 Ordensleuten, 10 männlichen und 97 weiblichen Ordensleuten, geleitet, die 10 Schulen und 20 karitative Einrichtungen verwalten. Die große Mehrheit von ihnen sind des römischen Ritus.