etter beleiringen Av Khartoum, nå plasseringen Av Graven Til Mahdi, byen vokste raskt. Men I Slaget Ved Omdurman i 1898 (som faktisk fant sted i den nærliggende landsbyen Kerreri), beseiret Lord Kitchener avgjørende Mahdist-styrkene og drepte Abdallahi ibn Muhammad, Khalifa, og sikret Britisk kontroll over Sudan.
i September 1898 invaderte Den Britiske hæren med tjue tusen brønnborede menn utstyrt med de nyeste våpen, Maxim-kanoner og Martini-Henry-rifler under Kommando av GeneralHoratio Herbert Kitchener Sudan. I slaget ved Omdurman møtte Den Britiske Hæren Sudanesiske forsvarere bestående av over 52 000 dårlig bevæpnede ørkenstammere dervishes; i løpet av fem timer var slaget over. De Sudanesiske forsvarerne led mange tap, med minst 10.000 drept. Derimot var det færre enn fire hundre tap på Britisk side med førtiåtte Britiske soldater mister livet. Deretter, General Kitchener fortsatte å bestille ødeleggelsen Av Mahdi grav og I Ordene Til Winston Churchill, «båret Av Mahdi hode i en parafin kan som et trofe».
Kitchener gjeninnførte Khartoum som hovedstad, Og Fra 1899 til 1956 Ble Sudan styrt av Storbritannia og Egypt. Selv om det meste av byen ble ødelagt i slaget, Ble Mahdis grav restaurert og pusset opp.
Den 10. Mai 2008 flyttet Darfur-opprørsgruppen Til Justice And Equality Movement inn i byen hvor De deltok i harde kamper med Sudanesiske regjeringsstyrker. Deres mål var å velte Omar Hassan Al-Bashir regjering.