Jak už název naznačuje, jsou nejméně dvě části hypothetico-deduktivní (h-d) metoda: hypothetico část, ve které hypotézy nebo teorie, vyplývající z jakéhokoli zdroje, je navržena pro test, a deduktivní část, ve které test důsledky jsou čerpány z hypotéz. Nezmíněné v názvu metody je rozhodující třetí část, ve které jsou důsledky odvozeny a porovnány s experimentem nebo s tím, co můžeme pozorovat. Důsledky procházejí nebo selhávají při srovnání. V některých případech může být hypotéza vynalezena tak, aby zohledňovala některé již známé skutečnosti; poté se testuje odvozením dalších důsledků, které jsou poté testovány. Vyvstává důležitá otázka, jak je verdikt pass nebo fail přenášen zpět do hypotézy; to vytváří problémy pro metodu h-d, jak bude vidět. Důsledky testu nemusí být získány pouze odečtením; pokud jsou hypotézy statistické, pak jsou důsledky odvozeny nededuktivním nebo induktivním uvažováním. Lepší název by tedy mohl být hypoteticko-inferenční metoda, která by pokryla oba případy deduktivní i nededuktivní inference.
metoda má dlouhou historii od doby Platóna, kdy v jeho dialozích šla jinými jmény, jako je „metoda hypotézy“. To bylo aplikováno na vědu ve středověku a od té doby má dlouhou účast s vědeckou metodou. To se stalo ústředním v debatě devatenáctého století o metodě mezi Whewellem a J.S. Millem. Někteří říkají, že jeho den nyní nadešel a jeho zapojení do metodiky je z velké části u konce. Úkolem této kapitoly je objasnit povahu této metody a její silné a slabé stránky.