VIII. Henrik aragóniai Katalinnal kötött házasságától való felmentés iránti kérelmét Kelemen nagyrészt figyelmen kívül hagyta, mivel Katalin unokaöccse véletlenül V. Károly császár volt. Henrik volt a házassága Catherine érvénytelennek nyilvánították, és feleségül vette Anne Boleyn januárjában 1533 ami a kiközösítés Kelemen július 11-én ugyanabban az évben.
mindeközben az Anglia elvesztése miatti zűrzavar közepette Luther Márton támadása a pápák elsőbbsége és a papi korrupció ellen csak sikerülhetett. V. Károly valójában segítette a reformációt azáltal, hogy lehetővé tette Luther számára, hogy befolyását kiterjessze egész Németországra. Ami befolyásolhatta az eredményt, az egy általános tanács volt, amelyet Kelemen nem hívott össze, ezáltal felgyorsítva a protestáns reform hatásait és növelve népszerűségét.
reformra nyilvánvalóan a katolikus egyházon belül volt szükség. Már 1517-ben megpróbálták megreformálni a közismerten korrupt vallási rendeket. A laikusokból és a papokból álló számos testvériség Egyesült, hogy odaadó papokat biztosítson a szentségek kezelésére és erkölcsileg példaértékű életre. Ezekhez az újonnan alakult rendekhez református rendek csatlakoztak, és nemcsak vezeklést gyakoroltak, ami nagyon hiányzott az általuk folytatott szekularizált gyakorlatokból, hanem a szegények szükségleteit is szolgálták. 1534-re Loyolai Ignác szellemi hadsereget szervezett az eretnekség elleni harcra és a pápa szolgálatára. Ők nevezték magukat Jézus Társaságának, a jezsuitáknak, és ők lettek a legfőbb eszközei annak, hogy konstruktív változást hozzanak létre egy erkölcsileg megalkuvó egyházban. A katolikus egyetemek megalapítása és missziós munkájuk a pápaság legfőbb védelmezőivé tette őket, és mind a mai napig befolyásosak.
Kelemen képességei és erősségei egy tudósé és a művészetek pártfogójáé voltak, nem pedig egy pápáé. Politikai sikertelensége, amely Róma kifosztását eredményezte, a protestáns hit Németországon túl Észak-Európa nagy részén elterjedt, és az Angliával való szakadás azonban nem csökkentette azt a jót, amelyet megpróbált tenni azáltal, hogy szembeszállt a spanyol inkvizíció túlzásaival és az akkoriban megkeresztelkedésre kényszerített zsidók iránti együttérzésével.
az ő érdeme volt az akkor készült műalkotások. Cellini ékszerész és szobrász, valamint Michaelangelo művei, akiket a Sixtus-kápolnában az utolsó ítélet megfestésére bízott, csak ketten voltak. Barátai voltak a legismertebb reneszánsz gondolkodókkal, mint Erasmus. Machiavelli történész védnöke volt. Kibővítette a Vatikáni könyvtárat, helyreállította és szépítette a római templomokat és épületeket, és befejezte a város erődítményeinek munkálatait.
VII. Kelemen 1534-ben halt meg, és unokatestvérével, X. Leó pápával szemben Santa Maria Sopra Minervában temették el.