Albert Sidney Johnston Washingtonban született, Kentucky, február 2-án, 1803. 1826-ban a West Point-i amerikai katonai akadémián tanult. Elhagyta az Egyesült Államok hadseregét, hogy csatlakozzon a hadsereghez Texasban, ahol főparancsnok és hadügyminiszter lett.
Johnston a mexikói háború alatt (1846-48) visszatért az Egyesült Államok hadseregébe, 1857-ben pedig James Buchanan elnök szövetségi csapatokkal Utahba küldte, hogy távolítsa el Brigham Youngot a hatalomból. Johnston az amerikai polgárháború kitöréséig a csendes-óceáni Minisztérium parancsnoka volt.
a Konföderációs Hadsereg tábornokaként 1861 májusában az Alleghenies-től nyugatra lévő összes csapat parancsnokságát kapta.
1862 áprilisában Johnston és Pierre T. Beauregard újraegyesítette seregeit a Tennessee-Mississippi vonal közelében. 55 000 emberrel most túlerőben voltak az Ulysses S. Grant által vezetett erőknél. Április 6-án a Konföderációs Hadsereg megtámadta Grant hadseregét Shiloh. Grant serege meglepetésre súlyos veszteségeket szenvedett Don Carlos Buell tábornok megérkezéséig és az erősítés megérkezéséig.
a harcok során április 6-án, 1862, Johnston megütötte a lábát egy golyó. Albert Sidney Johnston figyelmen kívül hagyta a sebet, és folytatta a harcot, amíg a súlyos vérveszteség miatt elvesztette az eszméletét és halálra vérzett. Ez szörnyű csapás volt a Konföderációs Hadsereg számára. Az uniós hadsereg vezetője, Ulysses Grant tábornok később kijelentette: “West Point-i kortársai, és általában a tisztek, akik később személyesen ismerték meg, és akik a mi oldalunkon maradtak, azt várták tőle, hogy bizonyítsa a legfélelmetesebb embert, akivel a Konföderáció találkozni fog.”