Review ArticleAn introduksjon til maksimal entropi tilnærming og dens anvendelse til slutning problemer i biologi

en hjørnestein i statistisk slutning, er maksimal entropi rammeverket blir stadig mer brukt til å konstruere beskrivende og prediktive modeller av biologiske systemer, spesielt komplekse biologiske nettverk, fra store eksperimentelle datasett. Både dens brede anvendelighet og suksessen den oppnådde i forskjellige sammenhenger avhenger av dens konseptuelle enkelhet og matematiske soliditet. Her prøver vi å kortfattet gjennomgå de grunnleggende elementene i det maksimale entropiprinsippet, med utgangspunkt i begrepet ‘entropi’ , og beskrive dets nytte for analyse av biologiske systemer. Som eksempler fokuserer vi spesielt på problemet med å rekonstruere geninteraksjonsnettverk fra uttrykksdata og på nyere arbeid som forsøker å utvide vår forståelse av bakteriell metabolisme på systemnivå. Til slutt fremhever vi noen utvidelser og potensielle begrensninger av maksimal entropi-tilnærming, og peker på nyere utviklinger som sannsynligvis vil spille en nøkkelrolle i de kommende utfordringene med å trekke ut strukturer og informasjon fra stadig mer rike biologiske data med høy gjennomstrømning.