fack har tre huvudroller. Den ena är att fastställa fysiska gränser för biologiska processer som gör det möjligt för cellen att utföra olika metaboliska aktiviteter samtidigt. Detta kan inkludera att hålla vissa biomolekyler inom en region eller hålla andra molekyler utanför. Inom de membranbundna facken isoleras olika intracellulära pH, olika enzymsystem och andra skillnader från andra organeller och cytosol. Med mitokondrier har cytosolen en oxiderande miljö som omvandlar NADH till NAD+. Med dessa fall är avdelningen fysisk.
en annan är att generera en specifik mikromiljö för att rumsligt eller temporärt reglera en biologisk process. Som ett exempel surgörs en jästvakuol normalt av protontransportörer på membranet.
en tredje roll är att fastställa specifika platser eller cellulära adresser för vilka processer ska inträffa. Till exempel kan en transkriptionsfaktor riktas till en kärna, där den kan främja transkription av vissa gener. När det gäller proteinsyntes är de nödvändiga organellerna relativt nära varandra. Kärnan i kärnhöljet är platsen för ribosomsyntes. Destinationen för syntetiserade ribosomer för proteinöversättning är grov endoplasmatisk retikulum (grov ER), som är ansluten till och delar samma membran med kärnan. Golgi-kroppen är också nära den grova ER för förpackning och omfördelning. På samma sätt tillåter intracellulär avdelning specifika platser för relaterade eukaryota cellfunktioner isolerade från andra processer och därför effektiva.