när Shabaka erövrade Nedre Egypten och därmed hävdade Nubiens styre åtföljdes han av sin brorson Taharqa, som var ungefär 20 år. Senare, under Shabakas regeringstid som Farao, konfronterade Egypten Assyriens växande makt på slagfältet. Taharqa var i spetsen för den egyptiska armen, men det är inte klart om de två styrkorna faktiskt kämpade. Taharqas bror Shabataka efterträdde Shabaka, och han gjorde Taharqa till sin käregent för att försäkra sig om hans arv. Omkring 688 f. Kr., ungefär 23 år efter att Nubiens styre hade införts över Egypten, tog Taharqa tronen i sig själv.
de närmaste åren var fredliga, och Taharqa flyttade sin huvudstad till Tanis i deltaet så att han kunde hålla sig väl informerad om händelser i de närliggande asiatiska länderna. År 671 f.Kr. närmade sig Egypten och Assyrien igen en konfrontation, så Taharqa förberedde sig för att kämpa för Egyptens fortsatta överlevnad. Men den assyriska kungen, Esarhaddon, korsade Sinaiöknen och besegrade Taharqas här på gränsen. I 2 veckor belägrade han Memphis. Den egyptiska armen smuldrade under attacken av den bättre disciplinerade Assyriska armen, som var beväpnad med järnvapen.
Taharqa flydde till Övre Egypten och lämnade Esarhaddon för att ta kontroll över Nedre Egypten. Två år senare återvände Taharqa med en ny här och lyckades återhämta kontrollen över deltaet, men denna framgång var kortlivad, och Esar-Haddons efterträdare, Ashurbanipal, körde Taharqa söderut igen. Efter detta slutliga nederlag försökte han aldrig mer kampanj i norr. Egypten gick sedan in i en lång era av successiva utländska härskare.
under sin period av Egyptiskt styre hade Taharqa uppmuntrat många arkitektoniska projekt, liksom hans nubiska föregångare. Han uppförde monument i Karnak, Thebe och Tanis i Nedre Egypten, och han byggde ett antal viktiga tempel i Cush, som den övre egyptiska nubiska staten då var känd. Under de senaste 8 åren av sitt liv i Cush fortsatte han att främja sina arkitektoniska intressen.
år 663 f.Kr. taharqa accepterades som en coregent Tanutamon, vars exakta förhållande till honom inte är klart. Nästa år dog Taharqa och begravdes i en pyramid i Nuri. Tanutamon hade omedelbart invaderat Nedre Egypten själv när han fick namnet coregent, och han lyckades få kontroll över det i nästan ett decennium, bara för att drivas ut av assyrierna, som Taharqa hade varit. Även om nubierna hade lyckats styra Egypten i bara cirka 75 år, överlevde deras rike Cush i norra Sudan i nästan ett årtusende.