Cuando Shabaka conquistó el Bajo Egipto y, por lo tanto, afirmó el gobierno nubio, fue acompañado por su sobrino Taharqa, que tenía aproximadamente 20 años. Más tarde, durante el reinado de Shabaka como faraón, Egipto se enfrentó al creciente poderío de Asiria en el campo de batalla. Taharqa estaba a la cabeza del ejército egipcio, pero no está claro si las dos fuerzas realmente lucharon. El hermano de Taharqa, Shabataka, sucedió a Shabaka, e hizo de Taharqa su corregente para asegurar su sucesión. Alrededor del 688 A. C., aproximadamente 23 años después de que se impusiera el gobierno nubio sobre Egipto, Taharqa asumió el trono por derecho propio.
Los siguientes años fueron pacíficos, y Taharqa trasladó su capital a Tanis en el Delta para que pudiera mantenerse bien informado sobre los acontecimientos en los países asiáticos vecinos. Hacia el año 671 a.de J.C., Egipto y Asiria se acercaron de nuevo a una confrontación, por lo que Taharqa se preparó para luchar por la supervivencia continua de Egipto. Pero el rey asirio, Asaradón, cruzó el desierto del Sinaí y derrotó al ejército de Taharqa en la frontera. En 2 semanas estaba sitiando Memphis. El ejército egipcio se derrumbó bajo el ataque del ejército asirio, mejor disciplinado, que estaba armado con armas de hierro.
Taharqa huyó al Alto Egipto, dejando Asaradón para tomar el control del Bajo Egipto. Dos años más tarde Taharqa regresó con un nuevo ejército y logró recuperar el control del Delta, pero este éxito fue de corta duración, y el sucesor de Asar-haddon, Asurbanipal, condujo a Taharqa al sur de nuevo. Después de esta derrota final, nunca volvió a intentar hacer campaña en el norte. Egipto entró entonces en una larga era de sucesivos gobernantes extranjeros.
Durante su período de gobierno egipcio Taharqa había alentado muchos proyectos arquitectónicos, al igual que sus predecesores nubios. Erigió monumentos en Karnak, Tebas y Tanis en el Bajo Egipto, y construyó varios templos importantes en Cus, como se conocía entonces al estado nubio del Alto Egipto. Durante los últimos 8 años de su vida en Cush, continuó fomentando sus intereses arquitectónicos.
En 663 a. C. Taharqa aceptó como un Tanutamon corregente, cuya relación precisa con él no está clara. Al año siguiente Taharqa murió y fue enterrada en una pirámide en Nuri. Tanutamon había invadido inmediatamente el Bajo Egipto cuando fue nombrado corregente, y logró hacerse con el control durante casi una década, solo para ser expulsado por los asirios, como lo había sido Taharqa. Aunque los nubios habían logrado gobernar Egipto durante solo unos 75 años, su reino de Cush en el norte de Sudán sobrevivió durante casi un milenio.