Popis
DSSO (disuccinimidyl sulfoxid) je MS-štěpitelné a membrána-propustná crosslinker, který obsahuje amin-reaktivní N-hydroxysuccinimide (NHS) ester na každém konci 7-uhlíkové distanční ruku. Usnadňuje analýzu struktury proteinů a komplexních interakcí pomocí hmotnostní spektrometrie. DSSO má podobnou reaktivitu k DSS a BS3, ale obsahuje linker, který může být štěpen v plynné fázi během tandemové MS (MS/MS) pomocí kolizí indukované disociace (CID). Schopnost štěpit zesíťované peptidy během MS / MS umožňuje metody získávání MS3, které usnadňují sekvenování peptidů pomocí tradičních databázových vyhledávačů. MS štěpení DSSO také generuje diagnostický ion kabátce během MS2, který umožňuje identifikaci zesítěných peptidů z mrtvých-end změny a vyhledávání pomocí román databáze vyhledávače jako XlinkX.
vlastnosti dsso:
* reaktivní skupiny: ester NHS (oba konce)
* reaktivní směrem: amino skupiny (primární aminy)
• Amin-reaktivní NHS ester reaguje rychle s primární aminy-obsahují molekulu
• Membrána propustná, umožňující intracelulární síťování
• High-čistota, krystalická činidlo může být použit k vytvoření vysoce-čistota konjugáty
• MS-štěpitelné
• nerozpustné ve Vodě (rozpouštějí první v DMF nebo DMSO)
specifikace:
• Čistota: > 90% kvantitativní NMR (nejvyšší standard v síťování čistota)
Chemické síťování v kombinaci s hmotnostní spektrometrií je mocný způsob, jak určit, protein-protein interakce. Tato metoda byla aplikována na rekombinantní a nativní proteinové komplexy a v poslední době na celé buněčné lyzáty nebo intaktní jednobuněčné organismy ve snaze identifikovat interakce protein-protein v globálním měřítku. Jak tradiční, non-štěpitelné a MS-štěpitelné crosslinkers poskytnout vhled do identifikace protein-protein interakce stránky, ale MS-štěpitelné crosslinkers jsou výhodné vzhledem k jejich schopnosti být štěpeny pomocí různých typů plynu, fáze roztříštěnosti metod (např. CID, HCD, ETD, a EtHCD) a úrovně tandemové hmotnostní spektrometrie (např., MS2 a MS3) v zájmu zlepšení identifikace zesítěné peptidy.