kuvaus
dsso (disukkinimidyylisulfoksidi) on MS-hajoava ja kalvoa läpäisevä poikkiviiva, joka sisältää amiinireaktiivisen N-hydroksisukkiini-imidin (NHS) Esterin 7-Hiilisen välikappaleen kummassakin päässä. Se helpottaa proteiinien rakenteen ja monimutkaisten vuorovaikutusten analysointia massaspektrometrialla. Dsso: lla on samanlainen reaktiivisuus kuin DSS: llä ja BS3: lla, mutta se sisältää linkkerin, joka voidaan halkaista kaasufaasissa tandem MS: n (MS/MS) aikana törmäyksen aiheuttaman dissosiaation (Cid) avulla. Kyky pilkkoa RISTISIDOTUT peptidit MS/MS: n aikana mahdollistaa MS3: n hankintamenetelmät, jotka helpottavat peptidien sekvensointia perinteisillä tietokantahakukoneilla. DSSO: n MS-pilkkominen tuottaa MS2: n aikana myös diagnostisia ionikaksosia, mikä mahdollistaa ristisidonnaisten peptidien tunnistamisen umpikujamuutoksista ja etsimisen uusien tietokantahakukoneiden, kuten XlinkX: n avulla.
Dsso: n ominaisuudet:
* reaktiiviset ryhmät: NHS-esterit (molemmat päät)
* reaktiiviset kohti: aminoryhmät (primääriset amiinit)
• Amiinireaktiivinen NHS-esteri reagoi nopeasti minkä tahansa primäärisen amiinia sisältävän molekyylin kanssa
* kalvo läpäisevä, mahdollistaen solunsisäisen ristisiteen
* erittäin puhdasta, kiteistä reagenssia voidaan käyttää erittäin puhtaiden konjugaattien valmistukseen
* MS-cleavable
* veteen liukenematon (liuotetaan ensin DMF: ään tai DMSO: han)
Lot TEKNISET TIEDOT:
* puhtaus: > 90% kvantitatiivisella NMR: llä (korkein standardi ristisidontapuhtaudessa)
Kemiallinen ristisidonta yhdistettynä massaspektrometriaan on tehokas menetelmä proteiinien ja proteiinien vuorovaikutusten määrittämiseksi. Tätä menetelmää on sovellettu rekombinantteihin ja alkuperäisiin proteiinikomplekseihin ja viime aikoina kokosolulysaatteihin tai koskemattomiin yksisoluisiin organismeihin pyrittäessä tunnistamaan proteiinin ja proteiinin välisiä vuorovaikutuksia maailmanlaajuisesti. Sekä perinteiset non-cleavable että MS-cleavable crosslinkers tarjoavat tietoa proteiinien ja proteiinien vuorovaikutuspaikkojen tunnistamisesta, mutta MS-cleavable crosslinkers ovat hyödyllisiä, koska ne voidaan halkaista käyttämällä erityyppisiä kaasufaasien fragmentointimenetelmiä (esim.CID, HCD, ETD ja Etcd) ja Tandem-massaspektrometrian tasoja (esim. MS2 ja MS3) ristisidonnaisten peptidien tunnistamisen parantamiseksi.