Beschreibung
DSSO (Disuccinimidylsulfoxid) ist ein MS-spaltbarer und membranpermeabler Vernetzer, der an jedem Ende eines 7-Kohlenstoff-Spacerarms einen aminreaktiven N-Hydroxysuccinimid (NHS) -Ester enthält. Es ermöglicht die Analyse der Proteinstruktur und komplexer Wechselwirkungen mittels Massenspektrometrie. DSSO hat eine ähnliche Reaktivität wie DSS und BS3, enthält jedoch einen Linker, der in der Gasphase während der Tandem-MS (MS / MS) durch kollisionsinduzierte Dissoziation (CID) gespalten werden kann. Die Fähigkeit, vernetzte Peptide während MS / MS zu spalten, ermöglicht MS3-Erfassungsmethoden, die die Peptidsequenzierung unter Verwendung herkömmlicher Datenbanksuchmaschinen erleichtern. Die MS-Spaltung von DSSO erzeugt auch diagnostische Ionendoubletten während MS2, was die Identifizierung von vernetzten Peptiden aus Sackgassenmodifikationen und die Suche mit neuartigen Datenbanksuchmaschinen wie XlinkX ermöglicht.
Eigenschaften von DSSO:
* Reaktive Gruppen: NHS-Ester (beide Enden)
* Reaktiv gegenüber: aminogruppen (primäre amine)
• Amin-reaktiven NHS ester reagiert schnell mit jedem primären amin-enthält molekül
• Membran durchlässig, so dass für intrazelluläre vernetzung
• Hohe-reinheit, kristallines reagenz kann verwendet werden, um hohe-reinheit konjugate
• MS-spaltbare
• Wasser-unlöslich (lösen erste in DMF oder DMSO)
Lot spezifikationen:
• Reinheit: > 90% durch quantitative NMR (der höchste Standard in der Vernetzungsreinheit)
Die chemische Vernetzung in Kombination mit Massenspektrometrie ist eine leistungsstarke Methode zur Bestimmung von Protein-Protein-Wechselwirkungen. Diese Methode wurde auf rekombinante und native Proteinkomplexe und in jüngerer Zeit auf Gesamtzelllysate oder intakte einzellige Organismen angewendet, um Protein-Protein-Wechselwirkungen auf globaler Ebene zu identifizieren. Sowohl herkömmliche nicht spaltbare als auch MS-spaltbare Vernetzer bieten Einblick in die Identifizierung von Protein-Protein-Interaktionsstellen, aber MS-spaltbare Vernetzer sind aufgrund ihrer Fähigkeit, unter Verwendung verschiedener Arten von Gasphasenfragmentierungsmethoden (z. B. CID, HCD, ETD und EtHCD) und Ebenen der Tandem-Massenspektrometrie (z. B. MS2 und MS3) gespalten zu werden, vorteilhaft, um die Identifizierung von vernetzten Peptiden zu verbessern.