Résumé
L’électrophorèse sur gel est l’une des techniques les plus importantes actuellement disponibles pour le fractionnement de l’ARN. La procédure expérimentale est relativement simple, mais permet néanmoins d’obtenir des résultats très reproductibles et de haute résolution. L’ARN est un polyanion et va donc migrer vers l’électrode positive dans un champ électrique. Si la migration se produit à travers une matrice de gel de taille de pores soigneusement choisie, la mobilité des molécules d’ARN est liée au logarithme des poids moléculaires: les plus petites molécules se déplaçant sur la plus grande distance. Les matrices de gel appropriées pour l’électrophorèse de l’ARN sont le polyacrylamide ou l’agarose sous forme de bâtonnets ou de dalles. L’agarose est généralement préféré à l’acrylamide en raison de sa facilité de manipulation et de sa toxicité moindre, bien que l’acrylamide donne une meilleure résolution de l’ARN de petit poids moléculaire. Les dalles présentent un certain nombre d’avantages par rapport aux gels à tige: ils permettent de fractionner de nombreux échantillons dans des conditions identiques, ils peuvent être facilement colorés et photographiés, et après électrophorèse, les acides nucléiques peuvent être transférés sur du papier nitrate de cellulose (Northern blot) pour des expériences d’hybridation par une procédure similaire à celle décrite au chapitre 5(1).