Abstrakt
Gelelektroforese er en av de viktigste teknikkene som for tiden er tilgjengelige for fraksjonering AV RNA. Den eksperimentelle prosedyren er relativt enkel, men oppnår likevel svært reproduserbare resultater og høy oppløsning. RNA er en polyanion og vil derfor migrere mot den positive elektroden i et elektrisk felt. Hvis migrasjonen skjer gjennom en gelmatrise av nøye valgt porestørrelse, er mobiliteten TIL RNA-molekylene relatert til logaritmen til molekylvektene: de minste molekylene beveger den største avstanden. Egnede gelmatriser for elektroforese AV RNA er polyakrylamid eller agarose i form av stenger eller plater. Agarose foretrekkes generelt fremfor akrylamid på grunn av sin enkle håndtering og lavere toksisitet, selv om akrylamid gir bedre oppløsning av RNA med liten molekylvekt. Plater har en rekke fordeler over stanggeler: de gjør det mulig for mange prøver å bli fraksjonert under identiske forhold, de kan lett farget og fotografert, og etter elektroforese kan nukleinsyrene overføres til cellulosenitratpapir (Nordblotting) for hybridiseringsforsøk ved en prosedyre som ligner den som er beskrevet i Kapittel 5 (1).