agaróz Gélelektroforézise absztrakt
a gélelektroforézis az egyik legfontosabb technika, amely jelenleg elérhető az RNS frakcionálásához. A kísérleti eljárás viszonylag egyszerű, de ennek ellenére nagyon reprodukálható eredményeket és nagy felbontást ér el. Az RNS egy polianion, ezért elektromos mezőben a pozitív elektróda felé vándorol. Ha a migráció gondosan kiválasztott pórusméretű gélmátrixon keresztül történik, akkor az RNS-molekulák mobilitása összefügg a molekulatömegek logaritmusával: a legkisebb molekulák mozgatják a legnagyobb távolságot. Az RNS elektroforéziséhez megfelelő gélmátrixok a poliakrilamid vagy agaróz rudak vagy lemezek formájában. Az agarózt általában előnyben részesítik az akrilamiddal szemben a könnyű kezelhetőség és az alacsonyabb toxicitás miatt, bár az akrilamid jobb felbontást biztosít a kis molekulatömegű RNS-ben. A födémeknek számos előnye van a rúdgélekkel szemben: lehetővé teszik számos minta azonos körülmények közötti frakcionálását, könnyen festhetők és lefényképezhetők, és elektroforézist követően a nukleinsavak hibridizációs kísérletekhez cellulóz-nitrát papírra (Northern bloting) vihetők át az 5.fejezet (1) bekezdésében leírtakhoz hasonló eljárással.