La conversión al cristianismo de Albania tuvo lugar bajo la influencia «latina» (rito romano) en el norte, bajo la influencia «griega» (rito bizantino) en el sur, y el cristianismo fue la primera y más antigua religión monoteísta del pueblo albanés. Después de la conquista otomana del siglo XV, alrededor de dos tercios de la población aceptó el islam. En 1967, Albania gobernada por comunistas fue declarada oficialmente un estado ateo.
Aunque el rito litúrgico griego se usó en muchas de sus iglesias, Albania fue parte del patriarcado de Roma hasta 731, cuando el emperador bizantino León III, en represalia por la oposición del Papa Gregorio III a la política iconoclasta del emperador, adjuntó la totalidad del Ilírico Oriental al patriarcado de Constantinopla.
Los católicos de Rito Romano se establecieron durante mucho tiempo en el norte del país. Una misión católica trabajó en el sur entre 1660, cuando el arzobispo ortodoxo se unió a la Iglesia Católica, y 1765, cuando el esfuerzo fue abandonado debido a los obstáculos colocados por los gobernantes otomanos. En 1895, un grupo de aldeas en Mali Shpati, al sureste de Elbasan, en Albania central, decidieron convertirse en católicos y exigieron un obispo de su propio rito, una propuesta a la que los representantes consulares de Rusia y Montenegro plantearon objeciones a las autoridades civiles. Casi al mismo tiempo, surgió otro grupo de greco-católicos, centrado en un archimandrita, Jorge Germano, que era sobrino del metropolitano ortodoxo en 1900, y concluyó un movimiento definitivo de unidad católica formado en Elbasan. Los números crecieron solo en pequeña medida, pero lo suficiente para que el sur de Albania se convirtiera en 1939 en una jurisdicción eclesiástica separada al cuidado de un Administrador Apostólico. Sin embargo, después de menos de siete años, el administrador fue expulsado, y el contacto parecía perdido con los fieles bizantinos, que se encontraban bajo un estricto gobierno comunista.
Solo en 1992 fue posible nombrar un nuevo administrador apostólico. Al principio, el cargo fue otorgado al representante diplomático de la Santa Sede en Tirana, el arzobispo Ivan Dias, quien más tarde se convirtió en Arzobispo de Mumbai y cardenal. El sucesor del Arzobispo Dias como Administrador Apostólico del Sur de Albania, no como Nuncio, es el obispo franciscano de Rito Bizantino nacido en Croacia, Hil Kabashi, que fue nombrado en 1996.
La administración apostólica del Sur de Albania tiene 3.200 católicos en nueve parroquias, con 11 iglesias, y es atendida por cuatro sacerdotes diocesanos y 10 religiosos, 10 religiosos y 97 religiosas, que administran 10 escuelas y 20 instituciones caritativas. La gran mayoría de ellos son de Rito Romano.