Description
dsso (disuccinimidyl sulfoxide) er EN MS-spaltbar og membranpermeabel tverrbinding som inneholder en amin-reaktiv n-hydroksysuccinimid (NHS) ester i hver ende av en 7-karbon avstandsarm. Det letter analyse av proteinstruktur og komplekse interaksjoner ved hjelp av massespektrometri. DSSO har lignende reaktivitet SOM DSS og BS3, men inneholder en linker som kan spaltes i gassfasen under tandem MS (MS/MS) ved hjelp av kollisjonsindusert dissosiasjon (CID). Evnen til å spalte tverrbundne peptider UNDER MS / MS muliggjør MS3 oppkjøpsmetoder, som letter peptidsekvensering ved hjelp av tradisjonelle databasesøkemotorer. MS-spaltningen av DSSO genererer også diagnostiske ion-dubletter under MS2, noe som muliggjør identifisering av tverrbundne peptider fra blindmodifikasjoner og søking ved hjelp av nye databasesøkemotorer som XlinkX.
Funksjoner AV DSSO:
• Reaktive grupper: NHS ester (begge ender)
* Reaktiv mot: amingrupper (primære aminer)
* Amin-reaktive nhs-ester reagerer raskt med et hvilket som helst primært aminholdig molekyl
* Membranpermeabel, som tillater intracellulær kryssbinding
* krystallinsk reagens Med høy renhet kan brukes til å skape høy renhetsgradskonjugater
* MS-spaltbar
* vannløselig (oppløses først i DMF eller DMSO)
Mye spesifikasjoner:Kjemisk kryssbinding i kombinasjon med massespektrometri er en kraftig metode for å bestemme protein-protein-interaksjoner. Denne metoden har blitt brukt på rekombinante og native proteinkomplekser, og mer nylig på hele cellelysater eller intakte encellede organismer i arbeidet med å identifisere protein-proteininteraksjoner på global skala. Både tradisjonelle ikke-spaltbare og MS-spaltbare krysskoblinger gir innsikt i identifisering av protein – protein interaksjonssteder, MEN MS-spaltbare krysskoblinger er fordelaktige på grunn av deres evne til å bli spaltet ved hjelp av forskjellige typer gassfasefragmenteringsmetoder (F.eks. CID, HCD, ETD og EtHCD) og nivåer av tandem massespektrometri (F. EKS. MS2 OG MS3) for å forbedre identifikasjonen av tverrbundne peptider.