Após o cerco de Cartum, agora a localização do túmulo do Mahdi, a cidade cresceu rapidamente. No entanto, na batalha de Omdurman em 1898 (que realmente ocorreu na aldeia vizinha de Kerreri), Lorde Kitchener derrotou decisivamente as forças Mahdistas e matou Abdallahi ibn Muhammad, o Khalifa, garantindo o controle britânico sobre o Sudão.
em setembro de 1898, o exército britânico de vinte mil homens bem treinados equipados com as armas mais baixas, as armas Maxim e as espingardas Martini-Henry sob o comando do GeneralHoratio Herbert Kitchener invadiram o Sudão. Na batalha de Omdurman, o Exército Britânico enfrentou defensores sudaneses consistindo de mais de 52.000 deserttribesmen dervishes mal armados; no espaço de cinco horas a batalha acabou. Os defensores sudaneses sofreram muitas baixas, com pelo menos 10.000 mortos. Em contraste, houve menos de quatrocentas baixas no lado britânico, com quarenta e oito soldados britânicos perdendo suas vidas. Em seguida, o General Kitchener começou a ordenar a destruição do túmulo de Mahdi e, nas palavras de Winston Churchill, “levado da cabeça de Mahdi em uma lata de querosene como um troféu”.Kitchener restaurou Cartum como capital e, de 1899 até 1956, o Sudão foi governado conjuntamente pela Grã-Bretanha e Egito. Embora a maior parte da cidade tenha sido destruída na batalha, o túmulo de Mahdi foi restaurado e remodelado.
em 10 de Maio de 2008, o grupo rebelde de Darfur do movimento Justiça e igualdade mudou-se para a cidade, onde eles se envolveram em fortes combates com as forças do governo sudanês. Seu objetivo era derrubar o governo de Omar Hassan al-Bashir.