Albert Sidney Johnston föddes i Washington, Kentucky, den 2 februari 1803. Han utbildades vid U. S. Military Academy vid West Point 1826. Han lämnade United States Army för att gå med i militären i Texas där han blev överbefälhavare och krigsminister.
Johnston återvände till USA Army under Mexikanska kriget (1846-48) och 1857 president James Buchanan skickade honom till Utah med federala trupper för att ta bort Brigham Young från makten. Johnston befallde Stillahavsområdet fram till utbrottet av amerikanska inbördeskriget.
beställd som general i Confederate Army i maj 1861 fick han befäl över alla trupper väster om Alleghenies.
i April 1862 återförenade Johnston och Pierre T. Beauregard sina trupper nära Tennessee-Mississippi-linjen. Med 55 000 män överträffade de nu de styrkor som leddes av Ulysses S. Grant. Den 6 April angrep Confederate Army Grants army i Shiloh. Överraskad LED Grants army stora förluster fram till ankomsten av General Don Carlos Buell och förstärkningar.
under striderna den 6 April 1862 träffades Johnston i benet av en kula. Albert Sidney Johnston ignorerade såret och fortsatte slåss tills den kraftiga blodförlusten ledde till att han förlorade medvetandet och blödde ihjäl. Detta var ett fruktansvärt slag mot Confederate Army. Ledaren för Union Army, General Ulysses Grant, uppgav senare: ”hans samtida på West Point, och officerare i allmänhet som lärde känna honom personligen senare och som var kvar på vår sida, förväntade sig att han skulle bevisa den mest formidabla mannen att möta som konfederationen skulle producera.”