TAP transportér se nachází v ER lumen spojeném s komplexem nakládání peptidů (PLC). Tento komplex β2 mikroglobulinu, kalretikulinu, ERp57, TAP, tapasinu a MHC třídy I působí tak, že drží molekuly MHC, dokud nejsou plně naloženy peptidy.
peptid transportEdit
TAP-zprostředkovaný transport peptidů je vícestupňový proces. Kapsa vázající peptid je tvořena TAP-1 a TAP-2. Asociace s TAP je ATP-nezávislé události, v rychle bimolecular sdružení krok, peptid se váže na TAP, následuje pomalý izomerizace na TAP komplexu. Předpokládá se, že konformační změna struktury spouští hydrolýzu ATP, a tak iniciuje transport peptidů.
obě domény vázající nukleotidy (NBD) jsou potřebné pro translokaci peptidů, protože každá NBD nemůže hydrolyzovat ATP Samostatně. Přesný mechanismus transportu není znám; zjištění však naznačují, že vazba ATP na TAP-1 je počátečním krokem v transportním procesu a že ATP vázaný na TAP-1 indukuje vazbu ATP v TAP-2. Bylo také prokázáno, že odpojení nabité MHC třídy I je spojeno s transportním cyklem TAP způsobeným signály z podjednotky TAP-1.
Transport mRNA z nucleusEdit
Kvasnice bílkovina Mex67p a lidské NXF1, také zvaný TAP, jsou dva nejlepší-vyznačuje NXFs (jaderné dopravy faktorů). TAPs zprostředkovávají interakci messengerové ribonukleoproteinové částice (mRNP) a komplexu jaderných pórů (NPC).NXFs nést žádnou podobnost s prototypem jaderné dopravy receptory importin – exportin (karyopherin) rodina a postrádají charakteristické Ran-vazebné domény nalézt ve všech karyopherins.
SpecificityEdit
Atpázové aktivity TAP je vysoce závislá na přítomnosti správného substrátu, a peptidová vazba je předpokladem pro hydrolýzy ATP. Tím se zabrání plýtvání ATP hydrolýzou nezávislou na peptidu.
specificita TAP proteinů byla nejprve zkoumána zachycením peptidů v ER pomocí glykosylace. TAP se váže na peptidy s 8 až 16 zbytky se stejnou afinitou, zatímco translokace je nejúčinnější pro peptidy, které jsou dlouhé 8 až 12 zbytků. Účinnost se snižuje u peptidů delších než 12 zbytků. Peptidy s více než 40 zbytky však byly translokovány, i když s nízkou účinností. Peptidy s nízkou afinitou k molekule MHC třídy I jsou transportovány z ER účinným exportním proteinem závislým na ATP. Tyto popsané mechanismy mohou představovat mechanismus pro zajištění toho, že pouze peptidy s vysokou afinitou jsou vázány na MHC třídu i.