de TAP transporter wordt gevonden in het ER lumen geassocieerd met het peptide-loading complex (PLC). Dit complex van β2 microglobuline, calreticuline, erp57, kraan, tapasin, en MHC klasse I handelt om greep van MHC molecules te houden totdat zij volledig met peptides zijn geladen.
Peptide transportEdit
TAP-gemedieerd peptide transport is een meerstapsproces. De peptide-bindende zak wordt gevormd door TAP-1 en TAP-2. Associatie met TAP is een ATP-onafhankelijke gebeurtenis, ‘in een snelle bimoleculaire associatie stap, bindt peptide aan TAP, gevolgd door een langzame isomerisatie van het TAP complex’. Men stelt voor dat de conformational verandering in structuur ATP hydrolyse teweegbrengt en zo peptide vervoer in werking stelt.
beide nucleotidebindende domeinen (nbds) zijn vereist voor peptide translocatie, aangezien elke NBD ATP niet alleen kan hydrolyseren. Het exacte transportmechanisme is niet bekend; de bevindingen wijzen er echter op dat ATP-binding aan TAP-1 de eerste stap is in het transportproces, en dat ATP-binding aan TAP-1 ATP-binding induceert in TAP-2. Het is ook aangetoond dat het loskoppelen van de geladen MHC klasse I is gekoppeld aan de transportcyclus van TAP veroorzaakt door signalen van de tap-1 subeenheid.
Transport van mRNA uit de nucleusEdit
Gistproteïne Mex67p en humaan NXF1, ook wel TAP genoemd, zijn de twee best gekarakteriseerde nxfs (nucleaire transportfactoren). TAPs bemiddelen de interactie van het messenger-ribonucleoproteïnedeeltje (mRNP) en het nuclear pore complex (NPC).Nxf ‘ s vertonen geen gelijkenis met prototypische nucleaire transportreceptoren van de importine – exportine (karyopherine) familie en missen het karakteristieke Ran-bindende domein dat in alle karyopherinen wordt aangetroffen.
Specificiteitedit
de ATPase-activiteit van TAP is sterk afhankelijk van de aanwezigheid van het juiste substraat, en peptidebinding is een vereiste voor ATP-hydrolyse. Dit voorkomt afval van ATP via peptide-onafhankelijke hydrolyse.
de specificiteit van TAP-eiwitten werd eerst onderzocht door peptiden in de ER vast te leggen met behulp van glycosylering. De kraan bindt aan 8 tot 16 residupeptides met gelijke affiniteit, terwijl de translocatie voor peptides het meest efficiënt is die 8 tot 12 lange residuen zijn. De Efficiency vermindert voor peptides langer dan 12 residuen. Nochtans, werden peptides met meer dan 40 residuen getranslocated, zij het met laag rendement. Peptides met lage affiniteit voor de MHC klasse I molecule worden getransporteerd uit ER door een efficiënte ATP-afhankelijke de uitvoerproteã ne. Deze geschetste mechanismen kunnen een mechanisme zijn om ervoor te zorgen dat alleen peptiden met hoge affiniteit gebonden zijn aan MHC-klasse I.