beschrijving
dsso (disuccinimidylsulfoxide) is een ms-cleavable en membraandoorlatende crosslinker die een amine-reactieve n-hydroxysuccinimide (NHS)-ester bevat aan elk uiteinde van een 7-carbon voorzetarm. Het vergemakkelijkt analyse van eiwitstructuur en complexe interactie gebruikend massaspectrometrie. DSSO heeft gelijkaardige reactiviteit aan DSS en BS3, maar bevat een linker die in de gasfase tijdens tandem MS (MS/MS) kan worden gespleten gebruikend botsing-veroorzaakte dissociatie (CID). De capaciteit om cross-linked peptides tijdens MS/MS te splitsen laat MS3 aanwinstmethodes toe, die peptide het rangschikken gebruikend traditionele de zoekmachines van het gegevensbestand vergemakkelijken. De splitsing van lidstaten van DSSO produceert ook kenmerkende ionend doublets tijdens MS2,die identificatie van cross-linked peptides van doodlopende wijzigingen toelaat en het zoeken gebruikend nieuwe motoren van het gegevensbestand zoals XlinkX.
kenmerken van DSSO:
* reactieve groepen: NHS ester (both ends)
* reactief naar: aminogroepen (primaire aminen)
* Amine-reactieve NHS-ester reageert snel met elke primaire Amine-bevattende molecule
* Membraanpermeabel, waardoor intracellulaire crosslinking
mogelijk is• kristallijn reagens met hoge zuiverheid kan worden gebruikt om conjugaten met hoge zuiverheid
te maken * MS-cleavable
* niet in Water oplosbaar (Los eerst op in DMF of DMSO)
Lotspecificaties:
* zuiverheid: > 90% door kwantitatieve NMR (de hoogste standaard in crosslinking zuiverheid)
chemische crosslinking in combinatie met massaspectrometrie is een krachtige methode om eiwit-eiwitinteracties te bepalen. Deze methode is toegepast op recombinante en inheemse eiwitcomplexen, en meer recent, op gehele cellysaten of intacte eencellige organismen in inspanningen om eiwit-eiwitinteractie op een globale schaal te identificeren. Zowel de traditionele, niet-splitsbare en MS-splitsbare crosslinkers geven inzicht in de identificatie van eiwit-eiwit interactie sites, maar MS-splitsbare crosslinkers zijn voordelig vanwege hun vermogen om te worden gesplitst met behulp van verschillende soorten gas fase fragmentatie methoden (bijv., CID, HCD, ETD, en EtHCD) en niveaus van tandem massaspectrometrie (bijv., MS2 en MS3) teneinde de identificatie van cross-linked peptiden.