opis
dsso (disuccinimidyl sulfoxide) jest rozszczepialnym i przepuszczalnym przez membranę sieciownikiem, który zawiera ester N-hydroksysukcynimidu aminy (NHS) na każdym końcu 7-węglowego ramienia dystansowego. Ułatwia analizę struktury białek i złożonych oddziaływań za pomocą spektrometrii masowej. DSSO ma podobną reaktywność do DSS i BS3, ale zawiera łącznik, który może być rozszczepiony w fazie gazowej podczas tandemowego MS (MS/MS) za pomocą dysocjacji wywołanej kolizją (Cid). Zdolność do rozszczepiania peptydów usieciowanych podczas MS / MS umożliwia metody akwizycji MS3, które ułatwiają sekwencjonowanie peptydów za pomocą tradycyjnych wyszukiwarek baz danych. Rozszczepienie MS DSSO generuje również diagnostyczne dublety jonowe podczas MS2, co umożliwia identyfikację peptydów usieciowanych z martwych modyfikacji i wyszukiwanie za pomocą nowych wyszukiwarek baz danych, takich jak XlinkX.
cechy DSSO: * reaktywne wobec: grupy aminowe (pierwszorzędowe aminy)specyfikacje partii:
* czystość: > 90% przez ilościowe NMR (najwyższy standard w czystości sieciowania)
chemiczne sieciowanie w połączeniu ze spektrometrią mas jest potężną metodą określania interakcji białko-białko. Metoda ta została zastosowana do rekombinowanych i natywnych kompleksów białkowych, a ostatnio do lizatów całych komórek lub nienaruszonych organizmów jednokomórkowych w wysiłkach identyfikacji interakcji białko-białko w skali globalnej. Zarówno tradycyjne sieciownice, które nie rozszczepiają się, jak i rozszczepialne MS, zapewniają wgląd w identyfikację miejsc interakcji białko-białko, ale sieciownice rozszczepialne MS są korzystne ze względu na ich zdolność do rozszczepiania przy użyciu różnych rodzajów metod fragmentacji fazy gazowej (np. CID, HCD, ETD i EtHCD) oraz poziomy tandemowej spektrometrii masowej (np. MS2 i MS3) w celu poprawy identyfikacji peptydów usieciowanych.