Il trasportatore TAP si trova nel lume ER associato al complesso di carico del peptide (PLC). Questo complesso di microglobulina β2, calreticulina, ERp57, TAP, tapasin e MHC classe I agisce per mantenere le molecole MHC fino a quando non sono state completamente caricate con peptidi.
Peptide transportEdit
TAP-mediata peptide trasporto è un processo multistep. La tasca peptide-legante è formata da TAP-1 e TAP-2. L’associazione con TAP è un evento indipendente dall’ATP, “in una fase di associazione bimolecolare veloce, il peptide si lega a TAP, seguito da una lenta isomerizzazione del complesso TAP”. Si suggerisce che il cambiamento conformazionale nella struttura inneschi l’idrolisi dell’ATP e quindi inizi il trasporto del peptide.
Entrambi i domini di legame nucleotidico (NBD) sono necessari per la traslocazione del peptide, poiché ogni NBD non può idrolizzare l’ATP da solo. L’esatto meccanismo di trasporto non è noto; tuttavia, i risultati indicano che il legame ATP a TAP-1 è il passo iniziale nel processo di trasporto e che l’ATP associato a TAP-1 induce il legame ATP in TAP-2. È stato anche dimostrato che lo sganciamento della classe MHC I caricata è legato al ciclo di trasporto di TAP causato dai segnali provenienti dalla subunità TAP-1.
Trasporto di mRNA dal nucleomodifica
La proteina di lievito Mex67p e la NXF1 umana, chiamata anche TAP, sono i due NXFs (nuclear transport factors) meglio caratterizzati. I rubinetti mediano l’interazione della particella ribonucleoproteina messaggero (mRNP) e del complesso dei pori nucleari (NPC).Gli NXFS non hanno alcuna somiglianza con i recettori di trasporto nucleare prototipici della famiglia importin-exportin (karyopherin) e mancano del caratteristico dominio di legame Ran trovato in tutte le carioferine.
SpecificityEdit
L’attività ATPasi di TAP è altamente dipendente dalla presenza del substrato corretto e il legame peptidico è prerequisito per l’idrolisi dell’ATP. Ciò impedisce lo spreco di ATP via idrolisi peptide-indipendente.
La specificità delle proteine TAP è stata studiata per la prima volta intrappolando i peptidi nell’ER utilizzando la glicosilazione. TAP si lega ai peptidi da 8 a 16 residui con uguale affinità, mentre la traslocazione è più efficiente per i peptidi lunghi da 8 a 12 residui. L’efficienza si riduce per peptidi più lunghi di 12 residui. Tuttavia, i peptidi con più di 40 residui sono stati traslocati, anche se con bassa efficienza. I peptidi con affinità bassa per la molecola di classe I di MHC sono trasportati dal ER da una proteina di esportazione ATP-dipendente efficiente. Questi meccanismi delineati possono rappresentare un meccanismo per garantire che solo i peptidi ad alta affinità siano legati alla classe MHC I.