Abstract
Gel electroforese é uma das técnicas mais importantes actualmente disponíveis para o fraccionamento do ARN. O procedimento experimental é relativamente simples, mas, no entanto, consegue resultados muito reprodutíveis e alta resolução. RNA é um polianião e, portanto, migra para o eletrodo positivo em um campo elétrico. Se a migração ocorrer através de uma matriz de gel de tamanho poro cuidadosamente escolhido, a mobilidade das moléculas de RNA está relacionada com o logaritmo dos pesos moleculares: as moléculas mais pequenas movendo a maior distância. As matrizes de gel adequadas para a electroforese do ARN são poliacrilamida ou agarose sob a forma de varetas ou placas. A Agarose é geralmente preferida à acrilamida devido à sua facilidade de manuseamento e menor toxicidade, embora a acrilamida dê uma melhor resolução do pequeno ARN de peso molecular. As brames têm uma série de vantagens sobre os géis rod: eles permitem que muitas amostras para ser fracionado em condições idênticas, elas podem ser facilmente coradas e fotografadas, e após a eletroforese de ácidos nucléicos pode ser transferido para o nitrato de celulose de papel (Northern blotting) para experimentos de hibridação por um procedimento semelhante ao descrito no Capítulo 5 (1).