der er forskellige beretninger om hans død. På en konto blev han slået ihjel af franske pirater i Marseille.
han foretog to rejser til løsepenge for fanger i 1240. Den første var til Murcia, hvor han købte friheden til otteoghalvfems slaver: den anden til Algier, hvor han indløste syvogfirs, men forblev selv en gidsel for den fulde betaling af pengene. En meget udbredt tidlig beretning hævder, at løsesummen ikke ankom i tide, og derfor besluttede hans fangere at få ham dræbt. Han blev spikret på et Røntgenformet kors og blev splittet.
den mest autoritative konto kommer fra Mercedarians tidlige annaler. “Fanget i Skotland af engelske pirater blev Serapion bundet af hænder og fødder til to poler og blev derefter slået, splittet og løsrevet. Endelig blev hans hals delvist afskåret og efterlod hovedet til at dingle.”
Barokkunstneren Francisco Surbar Larsn skildrer serapions død i et af hans malerier.
pave Benedikt erklærede ham for martyr og godkendte hans ærbødighed i hans ordre ved et dekret i 1728. Pave Benedict tilføjede ham til den romerske martyrologi. Serapion fejres den 14. November.