Der TAP-Transporter befindet sich im ER-Lumen, das mit dem Peptid-Loading-Komplex (PLC) assoziiert ist. Dieser Komplex aus β2-Mikroglobulin, Calreticulin, ERp57, TAP, Tapasin und MHC Klasse I wirkt, um MHC-Moleküle zu halten, bis sie vollständig mit Peptiden beladen sind.
Peptidtransportedit
TAP-vermittelter Peptidtransport ist ein mehrstufiger Prozess. Die Peptidbindungstasche wird durch TAP-1 und TAP-2 gebildet. Assoziation mit TAP ist ein ATP-unabhängiges Ereignis, ‚in einem schnellen bimolekularen Assoziationsschritt bindet Peptid an TAP, gefolgt von einer langsamen Isomerisierung des TAP-Komplexes‘. Es wird vermutet, dass die Konformationsänderung in der Struktur die ATP-Hydrolyse auslöst und so den Peptidtransport initiiert.
Beide Nukleotidbindungsdomänen (NBDs) sind für die Peptidtranslokation erforderlich, da jede NBD ATP nicht alleine hydrolysieren kann. Der genaue Mechanismus des Transports ist nicht bekannt; die Ergebnisse zeigen jedoch, dass die ATP-Bindung an TAP-1 der erste Schritt im Transportprozess ist und dass an TAP-1 gebundenes ATP die ATP-Bindung in TAP-2 induziert. Es hat sich auch gezeigt, dass das Abdocken der beladenen MHC-Klasse I mit dem Transportzyklus von TAP verbunden ist, der durch Signale der TAP-1-Untereinheit verursacht wird.
Transport von mRNA aus dem Kernbearbeiten
Das Hefeprotein Mex67p und das humane NXF1, auch TAP genannt, sind die beiden am besten charakterisierten NXFs (Nuclear Transport factors). TAPs vermitteln die Wechselwirkung des Boten-Ribonukleoprotein-Partikels (mRNP) und des Kernporenkomplexes (NPC).NXFs haben keine Ähnlichkeit mit prototypischen nuklearen Transportrezeptoren der Importin – Exportin (Karyopherin) -Familie und es fehlt ihnen die charakteristische Ran-Bindungsdomäne, die in allen Karyopherinen zu finden ist.
Spezifitätbearbeiten
Die ATPase-Aktivität von TAP hängt stark vom Vorhandensein des richtigen Substrats ab, und die Peptidbindung ist Voraussetzung für die ATP-Hydrolyse. Dies verhindert die Verschwendung von ATP durch peptidunabhängige Hydrolyse.
Die Spezifität von TAP-Proteinen wurde zuerst untersucht, indem Peptide in der ER mittels Glykosylierung eingefangen wurden. TAP bindet an Peptide mit 8 bis 16 Resten mit gleicher Affinität, während die Translokation für Peptide mit einer Länge von 8 bis 12 Resten am effizientesten ist. Effizienz reduziert für Peptide länger als 12 Monate. Peptide mit mehr als 40 Resten wurden jedoch transloziert, wenn auch mit geringer Effizienz. Peptide mit geringer Affinität für das MHC-Klasse-I-Molekül werden durch ein effizientes ATP-abhängiges Exportprotein aus dem ER transportiert. Diese skizzierten Mechanismen können einen Mechanismus darstellen, um sicherzustellen, dass nur hochaffine Peptide an MHC-Klasse I gebunden werden.