El transportador TAP se encuentra en el lumen ER asociado con el complejo de carga de péptidos (PLC). Este complejo de microglobulina β2, calreticulina, ERp57, TAP, tapasin y MHC clase I actúa para mantener las moléculas de MHC hasta que se hayan cargado completamente con péptidos.
Transporte de péptidos
El transporte de péptidos mediado por grifo es un proceso de varios pasos. El bolsillo de unión de péptidos está formado por TAP-1 y TAP-2. La asociación con TAP es un evento independiente del ATP, «en un paso de asociación bimolecular rápido, el péptido se une al TAP, seguido de una isomerización lenta del complejo TAP». Se sugiere que el cambio conformacional en la estructura desencadena la hidrólisis de ATP y, por lo tanto, inicia el transporte de péptidos.
Ambos dominios de unión a nucleótidos (NBDs) son necesarios para la translocación de péptidos, ya que cada NBD no puede hidrolizar ATP por sí solo. Se desconoce el mecanismo exacto de transporte; sin embargo, los hallazgos indican que la unión de ATP a TAP-1 es el paso inicial en el proceso de transporte, y que la unión de ATP a TAP-1 induce la unión de ATP en TAP-2. También se ha demostrado que el desacoplamiento del MHC clase I cargado está vinculado al ciclo de transporte de TAP causado por señales de la subunidad TAP-1.
Transporte de ARNm fuera del nucléoeditar
La proteína de levadura Mex67p y el NXF1 humano, también llamado TAP, son los dos factores de transporte nuclear (NXF) mejor caracterizados. Los TAPs median la interacción de la partícula de ribonucleoproteína mensajera (mRNP) y el complejo de poros nucleares (NPC).Los NXF no se parecen a los receptores de transporte nuclear prototípicos de la familia importina – exportina (carioferina) y carecen del dominio de unión a Ran característico que se encuentra en todas las carioferinas.
especifidadeditar
La actividad de la ATPasa del TAP depende en gran medida de la presencia del sustrato correcto, y la unión de péptidos es un requisito previo para la hidrólisis de ATP. Esto evita el desperdicio de ATP a través de hidrólisis independiente de péptidos.
La especificidad de las proteínas TAP se investigó por primera vez atrapando péptidos en la sala de emergencias mediante glicosilación. TAP se une a péptidos de 8 a 16 residuos con igual afinidad, mientras que la translocación es más eficiente para péptidos que tienen de 8 a 12 residuos de largo. La eficiencia se reduce para péptidos de más de 12 residuos. Sin embargo, se translocaron péptidos con más de 40 residuos, aunque con baja eficiencia. Los péptidos con baja afinidad por la molécula MHC clase I son transportados fuera de la sala de emergencias por una proteína de exportación eficiente dependiente de ATP. Estos mecanismos descritos pueden representar un mecanismo para garantizar que solo los péptidos de alta afinidad se unan a MHC clase I.