”Skyen saaren” gaelinkielinen nimi on T-Eilean Sgitheanach (tai Sgiathanach, uudempi ja harvinaisempi kirjoitusasu). Nimen merkitys ei ole selvä. Erilaisia etymologioita on ehdotettu, kuten” siivekäs saari ”tai” lovinen saari”, mutta lopullista ratkaisua ei ole toistaiseksi löydetty ja paikkanimi saattaa olla peräisin vielä tuntemattomasta substraattikielestä ja siten yksinkertaisesti läpinäkymätön.
esimerkiksi vuonna 1549 saarten Ylirovasti Donald Munro kirjoitti: ”This Ile is callit Ellan Skiannach in IIR, that is to say in Inglish the wyngit Ile, be reason it has mony wyngis and pointis lyand furth fra it, thir foirsaid Lochis”.
tämä ei suinkaan ollut ensimmäinen kirjallinen maininta. Roomalaisissa lähteissä mainitaan Skiitti (KS. Ravennan kosmografia) ja Sketis löytyy Ptolemaioksen kartasta. On myös ehdotettu mahdollista johdatusta varhaisesta kelttiläisestä ”siivekästä” tarkoittavasta sanasta * skitis, joka saattaa kuvata saaren niemiä, jotka säteilevät vuoristoisesta keskuksesta.
skandinaavisissa saagoissa Skye on nimeltään Skíð, esimerkiksi Hákonarin saagassa Hákonarsonar, ja Skaldisessa Saga Magnúsin runossa konungs berfœtts Heimskringlassa n. 1230. Muiden kirjoittajien mukaan siihen viitattiin Skandinaviassa nimillä skuy ”misty isle”, *skýey tai skuyö ”cloud isle”. Ei ole varmaa, onko saaren Gaelin runollinen nimi, Eilean a’ Cheò ”usvan saari”, edeltänyt vai jälkipäivittänyt norjalaisen nimen. Jotkut legendat yhdistävät saaren myös kuningatar Scáthachin myyttiseen hahmoon.
ehdotettujen Gaelin etymologioiden ongelmat voidaan tiivistää seuraavasti. Ensinnäkin ”siivekästä” tarkoittava gaelinkielinen sana on sgiathach, eikä sgiathanachia todisteta gaeliksi muuten kuin paikannimessä ja etnonyymissä Sgiathanach ”person from Skye”. Toiseksi, kirjatut ääntämykset kaikki osoittavat kohti selkeää edeltävää-ach-päätettä:,, tai . Tämä tarkoittaa, että muoto Sgiathanach ei todennäköisesti perustu Gaelinkieliseen monikkoon ”siipi” (sgiathan), joka sisältää Schwan viimeisellä tavulla () ja edustaisi hyvin epätavallista adjektiivista muotoa, joka perustuu monikon substantiiviin. Kolmanneksi diminutiivi/nominaliser-pääte-an johtaisi , jolloin viimeisellä tavulla olisi selvä. Tämä muoto sciathán tai sgiathan On todellakin todistettu nykyisissä Gaelin kielissä. Vanha Irlannin todistettu muoto on scíath (cognate modernin Walesin ysgwydd ”olkapää”) rekonstruoitu kelttiläinen muoto *skeito-, mikä viittaa Irlannin muodossa sgiathán on innovaatio ja epätodennäköinen juuri Sgiathanach. Lopuksi, johtaminen nimi scáthach sisältää kaksi pääasiallista ongelmaa: olisi kyse selittämätön palatalisation to ja selittämätön ylimääräinen elementti-an-.
roomalaisten ja kreikkalaisten muotojen, Scit – ja sket- (merkitys tuntematon), juuret voisivat olla Sgitheanachin juurta, sillä ne kehittyisivät säännöllisesti vanhaksi gaeliksi ja olisivat täysin looginen lähde todistetulle norjalaiselle Skíðille. Se johtaisi myös moderniin Sgitheanachiin säännöllisen suffigaation-an ja-ach kautta, joka muodostaa etnonyymin ja adjektiivin. Tämä selittäisi myös näennäisen kantamuodon käytön An Cuan Sgithissä (e) Minchissä (Ulko-Hebridit erottava Salmi Sisä-Hebrideistä) ja vanhemmassa irlantilaisessa muodossa Scíth nykyisen an tOileán Sgiathanachin sijaan, esimerkiksi: Do ṡiuḃal sé Scíṫ agus an dá Uiḃeast agus Beinn a’ Ṁaola… ”Hän matkusti Skyen, kahden uistin ja Benbeculan kanssa…”. Tällöin nimen tulkinta ”siivekkääksi” voi olla yksinkertaisesti kansanetymologian tapaus.
huhtikuussa 2007 tiedotusvälineissä kerrottiin, että Ylämaiden neuvosto oli vaihtanut saaren virallisen nimen Eilean a’ Cheòksi. Neuvosto kuitenkin selvensi, että tämä nimi viittasi vain yhteen sen 22 osastosta silloin lähestyvissä vaaleissa ja että ei ollut suunnitelmia muuttaa viittomakieltä tai lopettaa englanninkielinen nimi.