det gæliske navn for “Isle of Skye” er en t-Eilean Sgitheanach (eller Sgiathanach, en nyere og mindre almindelig stavemåde). Betydningen af dette navn er ikke klart. Forskellige etymologier er blevet foreslået, såsom den “vingede ø” eller “den hakkede ø”, men der er ikke fundet nogen endelig løsning til dato, og stednavnet kan være fra et endnu ukendt substratsprog og dermed simpelthen uigennemsigtigt.
for eksempel skriver i 1549, Donald Munro, højdekan på øerne skrev: “Denne Ile er callit Ellan Skiannach på irsk, det vil sige på engelsk, det er grunden til, at det har mony vrigis og pointis lyand videre fra det, kast opdelingen af thir foirsaid Lochis”.
dette var på ingen måde den første skriftlige reference. Romerske kilder henviser til Scitis (se Ravenna Cosmography) og Scetis kan findes på et kort af Ptolemæus. En mulig afledning fra *skitis, et tidligt keltisk ord for “bevinget”, som kan beskrive øens halvøer, der udstråler fra et bjergrigt centrum, er også blevet foreslået.
i de nordiske sagaer kaldes Skye sk karrusel, for eksempel i H karrusel sagaen h karrusel, og i et skaldisk digt i sagaen Magnus karrusel berf karrusel i Heimskringla fra ca. 1230. Ifølge andre forfattere, det blev omtalt i norrøn som skuy” misty isle”, *sk kurpey, eller skuy kurp”cloud isle”. Det er ikke sikkert, om det gæliske poetiske navn på øen, Eilean a’ Cherist “Isle of the mist” går forud for eller efterdaterer det nordiske navn. Nogle sagn forbinder også øen med den mytiske figur af Dronning SC Turthach.
problemerne med de foreslåede gæliske etymologier kan opsummeres som følger. For det første er det gæliske ord for “bevinget” sgiathach og sgiathanach er ikke attesteret på gælisk undtagen i stednavnet og etnonymet Sgiathanach “person fra Skye”. For det andet, de indspillede udtaler peger alle mod en klar forud for-ACH-slutningen:,, eller . Dette betyder, at formen Sgiathanach er meget usandsynligt, at den er baseret på gælisk flertal af “fløj” (sgiathan), som indeholder en sla i den sidste stavelse () og ville repræsentere en meget usædvanlig adjektivform baseret på et flertal substantiv. For det tredje, den diminutive/nominaliser slutter-en ville resultere i , med en klar i den sidste stavelse. Denne form for sciath larsn eller sgiathan er faktisk attesteret på de moderne gæliske sprog. Den gamle irske attesterede form er SC-karrat (beslægtet med moderne “skulder”) med en rekonstrueret keltisk form *skeito-, hvilket antyder, at den irske form sgiath-er en innovation og en usandsynlig rod for Sgiathanach. Langt om længe, at udlede navnet fra SC Pristhach involverer to hovedproblemer: der ville være et tilfælde af uforklarlig palatalisering af to og et uforklarligt ekstra element-en-.
rødderne til de romerske og græske former, Scit – og Scet- (hvilket betyder ukendt), kunne være roden til Sgitheanach, da de regelmæssigt ville udvikle sig til gammel gælisk og være en helt logisk kilde for den attesterede norrøne sk-kar. Det ville også føre til moderne Sgitheanach via en regelmæssig suffigation af-en og-ach at danne et etnonym og adjektiv. Dette ville også forklare brugen af en tilsyneladende rod i En Cuan Sgith(e) Minch (strædet, der adskiller det Ydre Hebrider fra de Indre Hebrider), og de ældre Irske form af Scíth snarere end En moderne tOileán Sgiathanach, for eksempel: har ṡiuḃal sé Scíṫ agus en dá Uiḃeast agus Beinn en’ Ṁaola… “Han rejste Skye og de to Uists og Benbecula…”. I dette tilfælde kan fortolkningen af navnet som “bevinget” simpelthen være et tilfælde af folkeetymologi.
i April 2007 blev det rapporteret i medierne, at øens officielle navn var blevet ændret af Highland-rådet til Eilean a’ Cherius. Rådet præciserede imidlertid, at dette navn kun henviste til en af dets 22 afdelinger i det daværende forestående valg, og at der ikke var planer om at ændre skiltning eller afbryde det engelske navn.