orgaaniset jätteet sisältävät aineksia, jotka ovat peräisin elävistä organismeista. Orgaanisia jätteitä on monenlaisia , ja niitä löytyy muun muassa yhdyskuntajätteistä , teollisuuden kiinteistä jätteistä, maatalousjätteistä ja jätevesistä. Orgaaniset jätteet hävitetään usein muiden jätteiden mukana kaatopaikoille tai polttolaitoksiin, mutta koska ne ovat biohajoavia , osa orgaanisista jätteistä soveltuu kompostoitavaksi ja maankäyttöön.
yhdyskuntajätteestä löytyviä orgaanisia materiaaleja ovat ruoka, paperi, puu , puhdistamoliete ja pihajäte . Kaatopaikkakapasiteetin viimeaikaisen puutteen vuoksi pihajätteiden kunnallisten kompostointipaikkojen määrä kasvaa koko maassa, samoin niiden kansalaisten määrä, jotka kompostoivat pihajätteitä takapihoillaan. Rajoitetummin tapahtuu myös jonkin verran yhdyskuntajätteen sekakompostointia. Näissä järjestelmissä epäorgaaniset aineet pyritään poistamaan ennen kompostointia.
osa yhdyskuntajätteen orgaanisista aineksista erotellaan ennen hävittämistä muuhun tarkoitukseen kuin kompostointiin. Esimerkiksi paperia ja kartonkia viedään yleisesti kierrätykseen . Ravintoloiden ja päivittäistavarakauppojen ruokahävikki hävitetään tyypillisesti jätehuollon kautta, joten siitä tulee jätevesi-ja jätevesilietteen osa.
suuri osa puhdistamolietteestä sijoitetaan kaatopaikalle ja poltetaan, mutta sitä levitetään yhä enemmän maahan lannoitteena . Puhdistamolietettä voidaan käyttää maatalouslannoitteena tai apuna avolouhoksen , metsäkadon ja epäorgaanisten lannoitteiden liikakäytön tuhoaman maan takaisin saamiseksi. Sitä voidaan soveltaa myös maahan ainoastaan hävittämiskeinona ilman, että tarkoituksena on parantaa maaperää .
teollisuusjätteen orgaaninen osuus kattaa laajan kirjon sisältäen suurimman osan yhdyskuntajätteen komponenteista sekä lukemattomia muita materiaaleja. Muutamia esimerkkejä teollisuuden orgaanisista jätteistä ovat paperimyllyliete, lihanjalostusjäte, panimojätteet ja tekstiilitehdaskuidut. Koska teollista orgaanista jätettä syntyy paljon erilaisia ja suuria määriä, on paljon mahdollisuuksia kierrättää ja kompostoida näitä materiaaleja. Jätehuoltajat kokeilevat jatkuvasti erilaisia ”reseptejä” teollisuuden orgaanisten jätteiden kompostoimiseksi maanparannusaineiksi ja maaperän muokkauksiksi. Osa käsitellyistä teollisuuden jätevesistä ja lietteistä sisältää suuria määriä orgaanisia aineita, ja niitäkin voidaan käyttää maaperän lannoitteina ja lisäyksinä.
biokaasun tuotanto on toinen orgaanisen jätteen käyttö. Biokaasua käytetään vaihtoehtoisena energialähteenä joissakin kolmannen maailman maissa. Sitä syntyy mädätysyksiköissä orgaanisten jätteiden, kuten manuusien ja viljelykasvien tähteiden, anaerobisessa hajoamisessa. Biokaasun tuotannon hyödyllisiä sivutuotteita ovat lietteet, joita voidaan käyttää maaperän lannoittamiseen ja parantamiseen, sekä taudinaiheuttajien inaktivointi jätteessä. Lisäksi käynnissä on tutkimus orgaanisten jätteiden käytöstä kehitysmaissa: 1) kalanviljelyssä, 2) levien tuottamiseen ihmisten ja eläinten ravinnoksi, lannoitteeksi ja muihin käyttötarkoituksiin sekä 3) vedessä käytettävien makrofyyttien tuottamiseen eläinten rehuksi.