Luther și reforma
Luther, fondatorul Reformei Protestante, și Melanchthon au răspuns reciproc cu entuziasm și prietenia lor profundă s-a dezvoltat. Melanchthon s-a dedicat din toată inima noii cauze Evanghelice, inițiată în anul precedent, când Luther și-a distribuit cele nouăzeci și cinci de teze. (Vezi nota cercetătorului: postarea tezelor.) Până la sfârșitul anului 1519 el apărase deja Autoritatea scripturală împotriva adversarului lui Luther, Johann Eck, a respins (înainte ca Luther să o facă) transubstanțierea—doctrina conform căreia substanța pâinii și a vinului din Cina Domnului este schimbată în trupul și sângele lui Hristos—a făcut din îndreptățirea prin credință piatra de temelie a teologiei sale și s-a rupt în mod deschis cu Reuchlin.
în acest timp a mai publicat încă șapte cărți mici și a obținut diploma de licență în teologie la Wittenberg. Energia lui era fenomenală. Și-a început ziua la 2:00 am și a dat prelegeri, de multe ori la cât mai multe 600 studenți, la 6:00. În plus, a găsit timp să o curteze pe Katherine Krapp, cu care s—a căsătorit în 1520 și care i-a născut patru copii-Anna, Philipp, Georg și Magdalen.
la îndemnul lui Luther, Melanchthon a ținut prelegeri despre scrisoarea lui Pavel către romani și în 1521 a publicat Loci communes rerum theologicarum („locurile comune teologice”), primul tratament sistematic al gândirii reformei. Păcatul, legea și harul au fost subiectele principale, cu liberul arbitru, jurămintele, speranța, mărturisirea și alte doctrine subsumate. Bazându-se pe Scriptură, Melanchthon a susținut că păcatul este mai mult decât un act extern; el ajunge dincolo de rațiune în voința și emoțiile umane, astfel încât omul individual nu poate rezolva pur și simplu să facă fapte bune și să câștige merite înaintea lui Dumnezeu. Păcatul originar este o înclinație nativă, o preocupare exagerată de sine care afectează toate acțiunile omului. Dar harul lui Dumnezeu îl consolează pe om cu iertare, iar lucrările omului, deși imperfecte, sunt un răspuns în bucurie și recunoștință pentru bunăvoința divină. Trei ediții ale comunelor Loci au apărut înainte de sfârșitul anului și 18 ediții până în 1525, pe lângă tipăririle unei traduceri germane. Ultima ediție din 1558 a fost mult mărită și schimbată. Luther a declarat că comunele Loci merită un loc în canonul scripturilor; Universitatea din Cambridge din Anglia a făcut mai târziu să fie citită, iar Regina Elisabeta I a memorat-o practic pentru a putea conversa despre teologie.
în ciuda unui decret imperial de moarte pentru cei care l-au susținut pe Luther, în 1521 Melanchthon a răspuns brusc condamnării Sorbonei a 104 declarații ale lui Luther cu „Împotriva Decretului furios al teologilor parizieni. Când Melanchthon a ezitat să-și publice prelegerile despre Corinteni, Luther a luat o copie și le-a publicat în 1521 cu o prefață spunând: „Eu sunt cel care publică aceste adnotări ale tale și te trimit la tine.”În 1523 Luther a făcut același lucru cu notele lui Melanchthon despre Ioan.
în 1521, în timpul șederii lui Luther pe Wartburg, Melanchthon a fost liderul cauzei Reformei la Wittenberg. După prima dietă din Speyer (1526), unde a fost stabilită o pace precară pentru mișcarea de reformă, Melanchthon a fost ales ca unul dintre cei 28 de comisari care au vizitat Saxonia și au reglementat Constituția bisericilor. În 1528 acest lucru a dus la publicarea Unterricht der Visitatoren („instrucțiuni pentru vizitatori”), un set de instrucțiuni pentru comisari. În plus față de o declarație de doctrină Evanghelică, conținea o schiță a educației pentru clasele elementare, care a fost adoptată în lege în Saxonia pentru a stabili primul sistem școlar public. Planul educațional al lui Melanchthon a fost copiat pe scară largă în toată Germania și cel puțin 56 de orașe i-au cerut sfatul în fondarea școlilor. Prin prelegerile și manualele sale și prin profesorii pe care i-a instruit, Melanchthon a exercitat o mare influență în Germania protestantă. El a ajutat la fondarea universităților din K-Nigsberg, Jena, și Marburg și le-a reformat pe cele din Greifswald, Wittenberg, Cologne, t-Inuxbingen, Leipzig, Heidelberg, Rostock, și Frankfurt an der Oder. Eforturile sale i-au adus titlul de „Preceptor al Germaniei.”